RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ARID2	Q68CP9	1835 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	DHRS12	A0PJE2	317 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	SOCS2	O14508	198 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	GFAP	P14136	432 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	EDNRB	P24530	442 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	S100A5	P33763	92 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	INAVA	Q3KP66	663 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	USP3	Q9Y6I4	520 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	SCN1A	P35498	2009 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157		M0QX08	132 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	AURKA	O14965	403 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC22A1	O15245	554 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	NUAK1	O60285	661 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	LRIG2	O94898	1065 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	FKBP9	O95302	570 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC7A1	P30825	629 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	MLLT10	P55197	1068 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	HERC3	Q15034	1050 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	SV2C	Q496J9	727 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIB2	Q92519	343 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	TEKT5	Q96M29	485 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	C12orf10	Q9HB07	376 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	TTK	P33981	857 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	PMS2P3	Q13401	168 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	PGS1	Q32NB8	556 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ERO1B	Q86YB8	467 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	OR2T3	Q8NH03	318 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	NPY6R	Q99463	290 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	RMND5A	Q9H871	391 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	NANOG	Q9H9S0	305 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	WDR81	Q562E7	1941 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A0J9YYE9	177 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	AP3B1	O00203	1094 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	DCLK1	O15075	740 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	IDH3B	O43837	385 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ANXA9	O76027	345 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	HK2	P52789	917 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	RAB39A	Q14964	217 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM110B	Q8TC76	370 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	FBXL20	Q96IG2	436 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF347	Q96SE7	839 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	ADI1	Q9BV57	179 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF39	Q9H2S5	420 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	BTRC	Q9Y297	605 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC22A2	O15244	555 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	CLPX	O76031	633 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNA5	P22460	613 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSUH2-208	ENST00000455157	PHC1	P78364	1004 aa		11.35	□□□□□ -0.59

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