RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 SEC23AQ15436 765 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 STON2Q8WXE9 905 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 NACC2Q96BF6 587 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 COL15A1P39059 1388 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 AP2A2O94973 939 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 GDF11O95390 407 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 MGAT1P26572 445 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 NR4A2P43354 598 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SULT1E1P49888 294 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CSHL1Q14406 222 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 TBCBQ99426 244 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SSX3Q99909 188 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SLC30A4O14863 429 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CHST10O43529 356 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 NEPROQ6NW34 567 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PEAK1Q9H792 1746 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 A0A0X1KG70 313 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 ERVK-8P63133 956 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 NPTX1Q15818 432 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CBWD6Q4V339 395 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SNX20Q7Z614 316 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 ANKFN1Q8N957 763 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 TMC2Q8TDI7 906 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 TWNKQ96RR1 684 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 MROQ9BYG7 248 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SP110Q9HB58 689 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SPON1Q9HCB6 807 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 TSTD3H0UI37 97 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 DLGAP1O14490 977 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SLC22A3O75751 556 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 MLYCDO95822 493 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 MLNP12872 115 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 TCF3P15923 654 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 DGKQP52824 942 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PLA2G16P53816 162 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 RAB10P61026 200 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CDH17Q12864 832 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SNAPC3Q92966 411 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 FAM84AQ96KN4 292 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CMAHPQ9Y471 501 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 USP31Q70CQ4 1352 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 MAP3K6O95382 1288 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CYP2F1P24903 491 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CDH4P55283 916 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 DEFA6Q01524 100 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.381e-7■■■■□ 26.5
SBNO1-202ENST00000420886 SLC51BQ86UW2 128 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 OR5J2Q8NH18 312 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC115Q96NT0 180 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CTRCQ99895 268 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CHRNA1P02708 482 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PTPN2P17706 415 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CD6P30203 668 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SNTA1Q13424 505 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CRY1Q16526 586 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 DESI1Q6ICB0 168 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CORO6Q6QEF8 472 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 EPGNQ6UW88 154 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PMEPA1Q969W9 287 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PKP3Q9Y446 797 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 BTN3A1O00481 513 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PGRMC2O15173 223 aa6.45□□□□□ -1.38
SBNO1-202ENST00000420886 PIAS1O75925 651 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms