RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 YKT6O15498 198 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 THEGLP0DJG4 465 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 CLDN2P57739 230 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 RAD51Q06609 339 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 TRAF2Q12933 501 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
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PTX4-201ENST00000293922 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa18.28■□□□□ 0.52
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF534Q76KX8 674 aa18.28■□□□□ 0.52
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PTX4-201ENST00000293922 OXR1Q8N573 874 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 KLHDC7BQ96G42 594 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 TRIB3Q96RU7 358 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 FSD1LQ9BXM9 530 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 FOXP3Q9BZS1 431 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 NFU1Q9UMS0 254 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa18.28■□□□□ 0.52
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PTX4-201ENST00000293922 OR13H1Q8NG92 308 aa18.27■□□□□ 0.52
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 SERPINB12Q96P63 405 aa18.27■□□□□ 0.52
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PTX4-201ENST00000293922 ARNT2Q9HBZ2 717 aa18.27■□□□□ 0.52
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PTX4-201ENST00000293922 AP3B1O00203 1094 aa18.25■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 NEMP1O14524 444 aa18.25■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 PIGNO95427 931 aa18.25■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 NDST3O95803 873 aa18.25■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 C1QTNF9P0C862 333 aa18.25■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 TIMP2P16035 220 aa18.25■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 HLA-DPA1P20036 260 aa18.25■□□□□ 0.51
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PTX4-201ENST00000293922 SLC1A5Q15758 541 aa18.25■□□□□ 0.51
PTX4-201ENST00000293922 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa18.25■□□□□ 0.51
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