RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259216.4

CFC1-201, Transcript of cripto, FRL-1, cryptic family 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFC1, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1-201ENST00000259216 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 LHX6Q9UPM6 363 aa20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 AK5Q9Y6K8 562 aa20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.17■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 A0A1W2PQM1 296 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 CST8O60676 142 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 USP12O75317 370 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 NDUFA10O95299 355 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 MPOP05164 745 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 CA4P22748 312 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 PTPN3P26045 913 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 LSSP48449 732 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 NR2C2P49116 596 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 TRIM74Q86UV6 250 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 FAM46DQ8NEK8 389 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 AGAP3Q96P47 875 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 ASCL3Q9NQ33 180 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 SUFUQ9UMX1 484 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.16■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 CACNA1GO43497 2377 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 GPR1P46091 355 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 SPINT3P49223 89 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 TFDP2Q14188 446 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 SPA17Q15506 151 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 TEX44Q53QW1 395 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 IGF2-ASQ6U949 168 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 TMEM139Q8IV31 216 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 WDR48Q8TAF3 677 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 HIC2Q96JB3 615 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 TEKT5Q96M29 485 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 GLOD4Q9HC38 313 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 APPL1Q9UKG1 709 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.15■□□□□ 0.82
CFC1-201ENST00000259216 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 FGF1P05230 155 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 ADCY8P40145 1251 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 GNPDA1P46926 289 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 GABREP78334 506 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 CCL7P80098 99 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 GALNT3Q14435 633 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 EXD1Q8NHP7 514 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 CRELD1Q96HD1 420 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.14■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.13■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.13■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.13■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 D6RAR5 112 aa20.13■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.13■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 GLB1P16278 677 aa20.13■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 ITPKBP27987 946 aa20.13■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 PPP2R5EQ16537 467 aa20.13■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 BBS12Q6ZW61 710 aa20.13■□□□□ 0.81
CFC1-201ENST00000259216 ZNF438Q7Z4V0 828 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms