RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 MUS81Q96NY9 551 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 MBOAT4Q96T53 435 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 USE1Q9NZ43 259 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 ANAPC2Q9UJX6 822 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 AURKCQ9UQB9 309 aa9.9□□□□□ -0.82
HCG18-242ENST00000602319 NFKB1P19838 968 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ADRA1AP35348 466 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 SLC26A3P40879 764 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 SULT1E1P49888 294 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 BACE1P56817 501 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 IFITM2Q01629 132 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 GRIK2Q13002 908 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ACAP2Q15057 778 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ITIH5Q86UX2 942 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 NSMCE3Q96MG7 304 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.9□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 NEMP2A6NFY4 417 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 AXIN1O15169 862 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 TGFB3P10600 412 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 GSK3BP49841 420 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 DAG1Q14118 895 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 SLX4IPQ5VYV7 408 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 LAYNQ6UX15 382 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 DPH6Q7L8W6 267 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 FAM131BQ86XD5 332 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 PROSER1Q86XN7 944 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 NETO2Q8NC67 525 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 GPR20Q99678 358 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CPNE5Q9HCH3 593 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 VTA1Q9NP79 307 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 STAP1Q9ULZ2 295 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 EVPLQ92817 2033 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 KCNK1O00180 336 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 KCNH1O95259 989 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 LDLRP01130 860 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CDH1P12830 882 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 BMP1P13497 986 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ARSFP54793 590 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ZBTB6Q15916 424 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 INAQ16352 499 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 UNC50Q53HI1 259 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 DEFB106AQ8N104 65 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 MIER2Q8N344 545 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CCNYQ8ND76 341 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 AGBL3Q8NEM8 1001 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 YIPF6Q96EC8 236 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 DACH2Q96NX9 599 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 HPS4Q9NQG7 708 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 MTRRQ9UBK8 725 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 NOX1Q9Y5S8 564 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 B4GAT1O43505 415 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 KDM1AO60341 852 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 NDST3O95803 873 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 RBP1P09455 135 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 STX1BP61266 288 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 LGI2Q8N0V4 545 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 LRRC52Q8N7C0 313 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ZFP90Q8TF47 636 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ASB2Q96Q27 587 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 DPEP3Q9H4B8 488 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 ANKHQ9HCJ1 492 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-242ENST00000602319 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms