RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 LRRC38Q5VT99 294 aa26.65■■□□□ 1.86
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ODC1-204ENST00000446285 RAET1GQ6H3X3 334 aa26.65■■□□□ 1.86
ODC1-204ENST00000446285 NYAP1Q6ZVC0 841 aa26.65■■□□□ 1.86
ODC1-204ENST00000446285 Q6ZVL8 140 aa26.65■■□□□ 1.86
ODC1-204ENST00000446285 ZNF765Q7L2R6 523 aa26.65■■□□□ 1.86
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ODC1-204ENST00000446285 RNF214Q8ND24 703 aa26.65■■□□□ 1.86
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ODC1-204ENST00000446285 ARRDC2Q8TBH0 407 aa26.64■■□□□ 1.86
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ODC1-204ENST00000446285 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
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ODC1-204ENST00000446285 C3orf38Q5JPI3 329 aa26.63■■□□□ 1.85
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ODC1-204ENST00000446285 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa26.62■■□□□ 1.85
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ODC1-204ENST00000446285 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
ODC1-204ENST00000446285 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
ODC1-204ENST00000446285 CCNJLQ8IV13 435 aa26.6■■□□□ 1.85
ODC1-204ENST00000446285 ARL14Q8N4G2 192 aa26.6■■□□□ 1.85
ODC1-204ENST00000446285 STRADBQ9C0K7 418 aa26.6■■□□□ 1.85
ODC1-204ENST00000446285 ABCG8Q9H221 673 aa26.6■■□□□ 1.85
ODC1-204ENST00000446285 SUFUQ9UMX1 484 aa26.6■■□□□ 1.85
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