RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 SRLQ86TD4 932 aa18.32■□□□□ 0.52
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PTX4-201ENST00000293922 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
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PTX4-201ENST00000293922 NSMCE3Q96MG7 304 aa18.32■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
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PTX4-201ENST00000293922 C16orf96A6NNT2 1141 aa18.32■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 SUN1O94901 812 aa18.32■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 PCDH8O95206 1070 aa18.32■□□□□ 0.52
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PTX4-201ENST00000293922 RAB7BQ96AH8 199 aa18.29■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 FEM1CQ96JP0 617 aa18.29■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 SLC17A9Q9BYT1 436 aa18.29■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 KLK13Q9UKR3 277 aa18.29■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 ITM2BQ9Y287 266 aa18.29■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 RAI2Q9Y5P3 530 aa18.29■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa18.28■□□□□ 0.52
PTX4-201ENST00000293922 AREL1O15033 823 aa18.28■□□□□ 0.52
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