RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 C7orf57Q8NEG2 295 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SGCDQ92629 289 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 ERGIC1Q969X5 290 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 CALML4Q96GE6 196 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 PGAM5Q96HS1 289 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 APOLD1Q96LR9 279 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM68Q96MH6 324 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 NLRP4Q96MN2 994 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SERINC2Q96SA4 455 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM47Q9BQJ4 181 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM79Q9BSE2 394 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 CENPOQ9BU64 300 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 ANKEF1Q9NU02 776 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHGB4Q9UN71 923 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 CEPT1Q9Y6K0 416 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SESN1Q9Y6P5 492 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM202A6NGA9 273 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 MS4A18H0YCH9 400 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 H0YGN5 161 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SOX30O94993 753 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 NDUFB4O95168 129 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 PGM3O95394 542 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 FTCDO95954 541 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 RB1P06400 928 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 CLTBP09497 229 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 GPTP24298 496 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 CLCN3P51790 818 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 ZP1P60852 638 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SORDQ00796 357 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 NUCB1Q02818 461 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 TRAF1Q13077 416 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 NAE1Q13564 534 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 MYBPC2Q14324 1141 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 GPR18Q14330 331 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 RABEP1Q15276 862 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 ADIPOQQ15848 244 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 ETFDHQ16134 617 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 C2orf68Q2NKX9 166 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 PRTGQ2VWP7 1150 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 CDONQ4KMG0 1287 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 RAB41Q5JT25 222 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 Q6ZSV7 163 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SEPT14Q6ZU15 432 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 MTSS1LQ765P7 747 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 MON1BQ7L1V2 547 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 GALNT5Q7Z7M9 940 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC13Q8IYE1 715 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM199Q8N511 208 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 ARRDC2Q8TBH0 407 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SLC25A28Q96A46 364 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 ERP27Q96DN0 273 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 VCPIP1Q96JH7 1222 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 FEM1CQ96JP0 617 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF570Q96NI8 536 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 MXD3Q9BW11 206 aa3.2□□□□□ -1.9
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PTPRC-205ENST00000391970 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM51Q9NW97 253 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 FBXL17Q9UF56 701 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 POLG2Q9UHN1 485 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM5Q9Y2B1 443 aa3.2□□□□□ -1.9
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PTPRC-205ENST00000391970 STON1Q9Y6Q2 735 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 MAU2Q9Y6X3 613 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa3.19□□□□□ -1.9
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PTPRC-205ENST00000391970 WDR91A4D1P6 747 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 B4DLN1 442 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SOCS2O14508 198 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 PPEF2O14830 753 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 WNT9BO14905 357 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 MOSPD3O75425 235 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 STARD3NLO95772 234 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 SYF2O95926 243 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
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