RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558649.5

RABGGTA-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 768 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-206ENST00000558649 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 A6NNZ2 444 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 HACD1B0YJ81 288 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 FPGTO14772 594 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 MMP2P08253 660 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 ALPIP09923 528 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 THEGLP0DJG4 465 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 RBL1P28749 1068 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 CTSKP43235 329 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 SKOR1P84550 965 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 RALGDSQ12967 914 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 RPS6KA1Q15418 735 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 PCSK7Q16549 785 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 TEX44Q53QW1 395 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 DPPA4Q7L190 304 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 TRIM58Q8NG06 486 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 OR13H1Q8NG92 308 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 HTR3CQ8WXA8 447 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 SMIM14Q96QK8 99 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 RTKNQ9BST9 563 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 GDF3Q9NR23 364 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 LAMA1P25391 3075 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 A0A0U1RQS6 177 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 POM121BA6NF01 834 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 MTSS1O43312 755 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 RBP3P10745 1247 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 NFKB1P19838 968 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 NFKBIAP25963 317 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 VIPR1P32241 457 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 NXPH1P58417 271 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 WASHC5Q12768 1159 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 XRCC4Q13426 336 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 GALNT3Q14435 633 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 ACOX1Q15067 660 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 IRF4Q15306 451 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 LIPIQ6XZB0 460 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 USP45Q70EL2 814 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 ZNF567Q8N184 647 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 SPATA22Q8NHS9 363 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 PIH1D2Q8WWB5 315 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 TEKT5Q96M29 485 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 GLOD4Q9HC38 313 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 TM7SF3Q9NS93 570 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 DLL3Q9NYJ7 618 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 UBP1Q9NZI7 540 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 DMXL1Q9Y485 3027 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 KCNN4O15554 427 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 MAGEC1O60732 1142 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 PCCBP05166 539 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 IGFALSP35858 605 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 ARHGEF7Q14155 803 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 LRRC14Q15048 493 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 CNGA3Q16281 694 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 Q6ZSR6 202 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 PID1Q7Z2X4 250 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 TSPAN33Q86UF1 283 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 IQCHQ86VS3 1027 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 BMFQ96LC9 184 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 FERMT1Q9BQL6 677 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 ZSCAN12O43309 604 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 FZD6O60353 706 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 PMPCBO75439 489 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 LHCGRP22888 699 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 CD68P34810 354 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 HNF1BP35680 557 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 CCT8P50990 548 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 OVGP1Q12889 678 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 TTC13Q8NBP0 860 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 DENND6BQ8NEG7 585 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 ASB12Q8WXK4 309 aa15.9■□□□□ 0.14
RABGGTA-206ENST00000558649 SPOCK2Q92563 424 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms