RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	PLAA	Q9Y263	795 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	MUC3A	Q02505	3323 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TRAF4-208	ENST00000469529	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TTC34	A8MYJ7	566 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529		K7EQS6	105 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	LDB2	O43679	373 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	BANF1	O75531	89 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ACSL3	O95573	720 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PDHA1	P08559	390 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TPH1	P17752	444 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SSTR1	P30872	391 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	STX2	P32856	288 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SUOX	P51687	545 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF844	Q08AG5	666 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	NAB1	Q13506	487 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	OLIG2	Q13516	323 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF234	Q14588	700 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PCSK7	Q16549	785 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	QPCT	Q16769	361 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXO43	Q4G163	708 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	EXOC2	Q96KP1	924 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TREX1	Q9NSU2	369 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	VPS18	Q9P253	973 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CHKB	Q9Y259	395 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0J9YYE9	177 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM159B	A6NKW6	160 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SIN3B	O75182	1162 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM155B	O75949	473 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CRTAM	O95727	393 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TRBC1	P01850	177 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	IVL	P07476	585 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CHRNA4	P43681	627 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	NUMB	P49757	651 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PTPN5	P54829	565 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	KDSR	Q06136	332 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CRYM	Q14894	314 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CDKN3	Q16667	212 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529		Q6ZVU0	165 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	FBF1	Q8TES7	1133 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	STYX	Q8WUJ0	223 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SCRN2	Q96FV2	425 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PGM2	Q96G03	612 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	MED4	Q9NPJ6	270 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	EURL	Q9NYK6	297 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SHISA7	A6NL88	538 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PRR33	A8MZF0	331 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	MAN2B1	O00754	1011 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	RASGRF2	O14827	1237 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CDH16	O75309	829 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PRNP	P04156	253 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SHBG	P04278	402 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	NFKBIA	P25963	317 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	HMGCL	P35914	325 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	GPS2	Q13227	327 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TRAF4-208	ENST00000469529	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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