RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641482.1

MFSD8-233, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

BASIC

Gene MFSD8, Length 4,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-233	ENST00000641482	CHADL	Q6NUI6	762 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	CFAP53	Q96M91	514 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	PEAK1	Q9H792	1746 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	PDE3B	Q13370	1112 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	NRAP	Q86VF7	1730 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	ACE	P12821	1306 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	FLT4	P35916	1363 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.71	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	STK26	Q9P289	416 aa		4.71	□□□□□ -1.65
MFSD8-233	ENST00000641482	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	CABP2	Q9NPB3	220 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	KDR	P35968	1356 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	COG3	Q96JB2	828 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	CABP1	Q9NZU7	370 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	FYB1	O15117	783 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	IL16	Q14005	1332 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	NUDC	Q9Y266	331 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	MRC1	P22897	1456 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	NUBP1	P53384	320 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	TOM1	O60784	492 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	FCHSD2	O94868	740 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	BCL9	O00512	1426 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	4.68	□□□□□ -1.66	3e-9	■■■■□ 20.7
MFSD8-233	ENST00000641482	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	TMC1	Q8TDI8	760 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	IP6K1	Q92551	441 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	GSE1	Q14687	1217 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	JCAD	Q9P266	1359 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	HSPA2	P54652	639 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	IL13	P35225	146 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	FAM212A	Q96EL1	285 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	SLIT2	O94813	1529 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	RGS12	O14924	1447 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	GLI3	P10071	1580 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MFSD8-233	ENST00000641482	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	C14orf37	Q86TY3	774 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	CERK	Q8TCT0	537 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	AAMP	Q13685	434 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MFSD8-233	ENST00000641482	RASEF	Q8IZ41	740 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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