RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598840.5

SAE1-209, Transcript of SUMO1 activating enzyme subunit 1, human

TSL 5 BASIC

Gene SAE1, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAE1-209	ENST00000598840	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
SAE1-209	ENST00000598840	IP6K1	Q92551	441 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SAE1-209	ENST00000598840	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
SAE1-209	ENST00000598840	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SAE1-209	ENST00000598840	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SAE1-209	ENST00000598840	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SAE1-209	ENST00000598840	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SAE1-209	ENST00000598840	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
SAE1-209	ENST00000598840	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SAE1-209	ENST00000598840	CHRNA2	Q15822	529 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SAE1-209	ENST00000598840	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
SAE1-209	ENST00000598840	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SAE1-209	ENST00000598840	CPD	O75976	1380 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SAE1-209	ENST00000598840	HMOX1	P09601	288 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SAE1-209	ENST00000598840	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SAE1-209	ENST00000598840	ABCA3	Q99758	1704 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SAE1-209	ENST00000598840	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
SAE1-209	ENST00000598840	RUNDC1	Q96C34	613 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SAE1-209	ENST00000598840	FCHSD2	O94868	740 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SAE1-209	ENST00000598840	EYA1	Q99502	592 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SAE1-209	ENST00000598840	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SAE1-209	ENST00000598840	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
SAE1-209	ENST00000598840	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SAE1-209	ENST00000598840	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SAE1-209	ENST00000598840	HSPA1L	P34931	641 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SAE1-209	ENST00000598840	APAF1	O14727	1248 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SAE1-209	ENST00000598840	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SAE1-209	ENST00000598840	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SAE1-209	ENST00000598840	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	COL18A1	P39060	1754 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	FAM83G	A6ND36	823 aa		33	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	PRKAR2B	P31323	418 aa		33	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	RGPD5	Q99666	1765 aa		33	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	ERBB3	P21860	1342 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SAE1-209	ENST00000598840	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.95	■■■□□ 2.86
SAE1-209	ENST00000598840	ABCC6	O95255	1503 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SAE1-209	ENST00000598840	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SAE1-209	ENST00000598840	NEFM	P07197	916 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SAE1-209	ENST00000598840	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SAE1-209	ENST00000598840	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
SAE1-209	ENST00000598840	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SAE1-209	ENST00000598840	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SAE1-209	ENST00000598840	KDR	P35968	1356 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SAE1-209	ENST00000598840	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SAE1-209	ENST00000598840	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SAE1-209	ENST00000598840	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SAE1-209	ENST00000598840	BTG4	Q9NY30	223 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SAE1-209	ENST00000598840	EVA1C	P58658	441 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SAE1-209	ENST00000598840	STRN4	Q9NRL3	753 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SAE1-209	ENST00000598840	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
SAE1-209	ENST00000598840	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
SAE1-209	ENST00000598840	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
SAE1-209	ENST00000598840	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SAE1-209	ENST00000598840	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
SAE1-209	ENST00000598840	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SAE1-209	ENST00000598840	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SAE1-209	ENST00000598840	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SAE1-209	ENST00000598840	RIPK4	P57078	832 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SAE1-209	ENST00000598840	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SAE1-209	ENST00000598840	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SAE1-209	ENST00000598840	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SAE1-209	ENST00000598840	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SAE1-209	ENST00000598840	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	LRP6	O75581	1613 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SAE1-209	ENST00000598840	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.7	■■■□□ 2.82
SAE1-209	ENST00000598840	USP35	Q9P2H5	1018 aa		32.7	■■■□□ 2.82
SAE1-209	ENST00000598840	GOLGA2	Q08379	1002 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SAE1-209	ENST00000598840	CRB1	P82279	1406 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SAE1-209	ENST00000598840	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SAE1-209	ENST00000598840	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SAE1-209	ENST00000598840	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
SAE1-209	ENST00000598840	SLIT2	O94813	1529 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SAE1-209	ENST00000598840	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SAE1-209	ENST00000598840	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SAE1-209	ENST00000598840	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.65	■■■□□ 2.82

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