RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, human

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNDBP1-208	ENST00000566515	EVA1C	P58658	441 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
CCNDBP1-208	ENST00000566515	VPS72	Q15906	364 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CCNDBP1-208	ENST00000566515	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	GLI3	P10071	1580 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NSD2	O96028	1365 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ABCC6	O95255	1503 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	AMPH	P49418	695 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MORC1	Q86VD1	984 aa		28.64	■■■□□ 2.18
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	IP6K1	Q92551	441 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	USP35	Q9P2H5	1018 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	HOXC9	P31274	260 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PEAK1	Q9H792	1746 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RGS12	O14924	1447 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CRB1	P82279	1406 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	POLK	Q9UBT6	870 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RTL1	A6NKG5	1358 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ERBB3	P21860	1342 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCNDBP1-208	ENST00000566515	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CCNDBP1-208	ENST00000566515	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		28.54	■■■□□ 2.16
CCNDBP1-208	ENST00000566515	FLT4	P35916	1363 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CCNDBP1-208	ENST00000566515	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CCNDBP1-208	ENST00000566515		A0A0G2JS52	829 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MYT1	Q01538	1121 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		28.52	■■■□□ 2.16
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		28.51	■■■□□ 2.15
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		28.51	■■■□□ 2.15
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		28.51	■■■□□ 2.15
CCNDBP1-208	ENST00000566515	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		28.5	■■■□□ 2.15
CCNDBP1-208	ENST00000566515	INSR	P06213	1382 aa		28.5	■■■□□ 2.15
CCNDBP1-208	ENST00000566515	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		28.48	■■■□□ 2.15
CCNDBP1-208	ENST00000566515	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
CCNDBP1-208	ENST00000566515	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
CCNDBP1-208	ENST00000566515	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		28.48	■■■□□ 2.15
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.15
CCNDBP1-208	ENST00000566515	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		28.44	■■■□□ 2.14
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MTHFS	P49914	203 aa		28.42	■■■□□ 2.14
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		28.41	■■■□□ 2.14
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NBPF4	Q96M43	638 aa		28.41	■■■□□ 2.14
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		28.39	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		28.38	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DISP2	A7MBM2	1401 aa		28.37	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	LRRC37A3	O60309	1634 aa		28.35	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	IL2RB	P14784	551 aa		28.34	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	EP400	Q96L91	3159 aa		28.34	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SOCS7	O14512	581 aa		28.33	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PPP2R1A	P30153	589 aa		28.33	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	FAM182B	Q5T319	152 aa		28.33	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	EYA1	Q99502	592 aa		28.33	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		28.33	■■■□□ 2.13
CCNDBP1-208	ENST00000566515	PDE3B	Q13370	1112 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DDB1	Q16531	1140 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CCNDBP1-208	ENST00000566515	EXOC5	O00471	708 aa		28.29	■■■□□ 2.12
CCNDBP1-208	ENST00000566515	IL13	P35225	146 aa		28.28	■■■□□ 2.12
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MEGF6	O75095	1541 aa		28.27	■■■□□ 2.12
CCNDBP1-208	ENST00000566515	NCAPD2	Q15021	1401 aa		28.26	■■■□□ 2.12
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		28.25	■■■□□ 2.11
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TNS2	Q63HR2	1409 aa		28.25	■■■□□ 2.11
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RALBP1	Q15311	655 aa		28.25	■■■□□ 2.11
CCNDBP1-208	ENST00000566515	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.24	■■■□□ 2.11
CCNDBP1-208	ENST00000566515	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
CCNDBP1-208	ENST00000566515	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
CCNDBP1-208	ENST00000566515	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		28.23	■■■□□ 2.11
CCNDBP1-208	ENST00000566515	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
CCNDBP1-208	ENST00000566515	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
CCNDBP1-208	ENST00000566515	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	28.22	■■■□□ 2.11
CCNDBP1-208	ENST00000566515	CFAP53	Q96M91	514 aa		28.21	■■■□□ 2.11
CCNDBP1-208	ENST00000566515	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		28.21	■■■□□ 2.11
CCNDBP1-208	ENST00000566515	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.19	■■■□□ 2.1
CCNDBP1-208	ENST00000566515	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
CCNDBP1-208	ENST00000566515	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		28.18	■■■□□ 2.1

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