RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 SOX12O15370 315 aa27.64■■■□□ 2.02
CMTM3-211ENST00000565922 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.63■■■□□ 2.01
CMTM3-211ENST00000565922 CRB1P82279 1406 aa27.62■■■□□ 2.01
CMTM3-211ENST00000565922 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC125Q86Z20 511 aa27.61■■■□□ 2.01
CMTM3-211ENST00000565922 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.61■■■□□ 2.01
CMTM3-211ENST00000565922 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
CMTM3-211ENST00000565922 BARGINQ6ZT62 677 aa27.6■■■□□ 2.01
CMTM3-211ENST00000565922 USP35Q9P2H5 1018 aa27.6■■■□□ 2.01
CMTM3-211ENST00000565922 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CMTM3-211ENST00000565922 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.59■■■□□ 2.01
CMTM3-211ENST00000565922 COG3Q96JB2 828 aa27.59■■■□□ 2.01
CMTM3-211ENST00000565922 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.59■■■□□ 2.01
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CMTM3-211ENST00000565922 EP400Q96L91 3159 aa27.58■■■□□ 2.01
CMTM3-211ENST00000565922 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.56■■■□□ 2
CMTM3-211ENST00000565922 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.55■■■□□ 2
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CMTM3-211ENST00000565922 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.54■■■□□ 2
CMTM3-211ENST00000565922 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.52■■■□□ 2
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CMTM3-211ENST00000565922 LRRC37A3O60309 1634 aa27.48■■□□□ 1.99
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC7Q96M83 1385 aa27.48■■□□□ 1.99
CMTM3-211ENST00000565922 PDE3BQ13370 1112 aa27.47■■□□□ 1.99
CMTM3-211ENST00000565922 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
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CMTM3-211ENST00000565922 ERBB3P21860 1342 aa27.46■■□□□ 1.99
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CMTM3-211ENST00000565922 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.45■■□□□ 1.99
CMTM3-211ENST00000565922 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.43■■□□□ 1.98
CMTM3-211ENST00000565922 IP6K1Q92551 441 aa27.43■■□□□ 1.98
CMTM3-211ENST00000565922 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.43■■□□□ 1.98
CMTM3-211ENST00000565922 RTL1A6NKG5 1358 aa27.43■■□□□ 1.98
CMTM3-211ENST00000565922 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.42■■□□□ 1.98
CMTM3-211ENST00000565922 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CMTM3-211ENST00000565922 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CMTM3-211ENST00000565922 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.41■■□□□ 1.98
CMTM3-211ENST00000565922 AMPHP49418 695 aa27.4■■□□□ 1.98
CMTM3-211ENST00000565922 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.4■■□□□ 1.98
CMTM3-211ENST00000565922 DDB1Q16531 1140 aa27.39■■□□□ 1.98
CMTM3-211ENST00000565922 FAM182BQ5T319 152 aa27.38■■□□□ 1.97
CMTM3-211ENST00000565922 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.38■■□□□ 1.97
CMTM3-211ENST00000565922 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.37■■□□□ 1.97
CMTM3-211ENST00000565922 DISP2A7MBM2 1401 aa27.37■■□□□ 1.97
CMTM3-211ENST00000565922 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.36■■□□□ 1.97
CMTM3-211ENST00000565922 HOXC9P31274 260 aa27.36■■□□□ 1.97
CMTM3-211ENST00000565922 BAG6P46379 1132 aa27.36■■□□□ 1.97
CMTM3-211ENST00000565922 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CMTM3-211ENST00000565922 PEAK1Q9H792 1746 aa27.36■■□□□ 1.97
CMTM3-211ENST00000565922 SBF2Q86WG5 1849 aa27.34■■□□□ 1.97
CMTM3-211ENST00000565922 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CMTM3-211ENST00000565922 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.33■■□□□ 1.97
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CMTM3-211ENST00000565922 PANK3Q9H999 370 aa27.33■■□□□ 1.97
CMTM3-211ENST00000565922 TNS2Q63HR2 1409 aa27.33■■□□□ 1.96
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CMTM3-211ENST00000565922 FBLN1P23142 703 aa27.31■■□□□ 1.96
CMTM3-211ENST00000565922 NSD2O96028 1365 aa27.31■■□□□ 1.96
CMTM3-211ENST00000565922 EXOC5O00471 708 aa27.3■■□□□ 1.96
CMTM3-211ENST00000565922 IL2RBP14784 551 aa27.3■■□□□ 1.96
CMTM3-211ENST00000565922 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.3■■□□□ 1.96
CMTM3-211ENST00000565922 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CMTM3-211ENST00000565922 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.29■■□□□ 1.96
CMTM3-211ENST00000565922 TRIM37O94972 964 aa27.28■■□□□ 1.96
CMTM3-211ENST00000565922 INSRP06213 1382 aa27.27■■□□□ 1.96
CMTM3-211ENST00000565922 BCL9O00512 1426 aa27.26■■□□□ 1.95
CMTM3-211ENST00000565922 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.24■■□□□ 1.95
CMTM3-211ENST00000565922 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.23■■□□□ 1.95
CMTM3-211ENST00000565922 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CMTM3-211ENST00000565922 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.23■■□□□ 1.95
CMTM3-211ENST00000565922 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
CMTM3-211ENST00000565922 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CMTM3-211ENST00000565922 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.21■■□□□ 1.95
CMTM3-211ENST00000565922 APBA3O96018 575 aa27.2■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.2■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 RREB1Q92766 1687 aa27.19■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.18■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 NHSQ6T4R5 1651 aa27.17■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.17■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.16■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.15■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 NBPF4Q96M43 638 aa27.15■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 POLKQ9UBT6 870 aa27.15■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 MORC1Q86VD1 984 aa27.14■■□□□ 1.94
CMTM3-211ENST00000565922 MEGF6O75095 1541 aa27.13■■□□□ 1.93
CMTM3-211ENST00000565922 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CMTM3-211ENST00000565922 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.13■■□□□ 1.93
CMTM3-211ENST00000565922 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.13■■□□□ 1.93
CMTM3-211ENST00000565922 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.13■■□□□ 1.93
CMTM3-211ENST00000565922 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CMTM3-211ENST00000565922 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CMTM3-211ENST00000565922 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.09■■□□□ 1.93
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