RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	PPP4C	P60510	307 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC175	P0C221	793 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TNNT1	P13805	278 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	PAX7	P23759	505 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TBX4	P57082	545 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	MECOM	Q03112	1051 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65	3e-6	■■■□□ 15.2
CNOT2-231	ENST00000551483	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TRIM66	O15016	1216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CD53	P19397	219 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ABCD1	P33897	745 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	UVSSA	Q2YD98	709 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	KCNB2	Q92953	911 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	HIP1R	O75146	1068 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	VDR	P11473	427 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM161A	Q3B820	660 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	STK25	O00506	426 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	KIF5C	O60282	957 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	LDHC	P07864	332 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	KCNA2	P16389	499 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CCP110	O43303	1012 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	IGHD	P01880	384 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TOMM20	Q15388	145 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CTAGE5	O15320	804 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	PEX19	P40855	299 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	GOPC	Q9HD26	462 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	COQ9	O75208	318 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	KCTD2	Q14681	263 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	PRC1	O43663	620 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	TRIM29	Q14134	588 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CNOT2-231	ENST00000551483	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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