RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.3■■■□□ 2.44
PTPRK-222ENST00000532751 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.28■■■□□ 2.44
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa30.28■■■□□ 2.44
PTPRK-222ENST00000532751 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
PTPRK-222ENST00000532751 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
PTPRK-222ENST00000532751 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.26■■■□□ 2.44
PTPRK-222ENST00000532751 A0A0G2JS52 829 aa30.26■■■□□ 2.43
PTPRK-222ENST00000532751 MYT1Q01538 1121 aa30.26■■■□□ 2.43
PTPRK-222ENST00000532751 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
PTPRK-222ENST00000532751 SEPT12Q8IYM1 358 aa30.26■■■□□ 2.43
PTPRK-222ENST00000532751 PANK3Q9H999 370 aa30.26■■■□□ 2.43
PTPRK-222ENST00000532751 AXIN2Q9Y2T1 843 aa30.26■■■□□ 2.43
PTPRK-222ENST00000532751 BRWD3Q6RI45 1802 aa30.26■■■□□ 2.43
PTPRK-222ENST00000532751 USP35Q9P2H5 1018 aa30.24■■■□□ 2.43
PTPRK-222ENST00000532751 CRB1P82279 1406 aa30.23■■■□□ 2.43
PTPRK-222ENST00000532751 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.22■■■□□ 2.43
PTPRK-222ENST00000532751 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa30.21■■■□□ 2.43
PTPRK-222ENST00000532751 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa30.21■■■□□ 2.43
PTPRK-222ENST00000532751 TCP11L2Q8N4U5 519 aa30.2■■■□□ 2.43
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PTPRK-222ENST00000532751 BARGINQ6ZT62 677 aa30.18■■■□□ 2.42
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC7Q96M83 1385 aa30.17■■■□□ 2.42
PTPRK-222ENST00000532751 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
PTPRK-222ENST00000532751 AMPHP49418 695 aa30.16■■■□□ 2.42
PTPRK-222ENST00000532751 IP6K1Q92551 441 aa30.16■■■□□ 2.42
PTPRK-222ENST00000532751 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.16■■■□□ 2.42
PTPRK-222ENST00000532751 KRT27Q7Z3Y8 459 aa30.15■■■□□ 2.42
PTPRK-222ENST00000532751 FBLN1P23142 703 aa30.14■■■□□ 2.42
PTPRK-222ENST00000532751 KNSTRNQ9Y448 316 aa30.14■■■□□ 2.42
PTPRK-222ENST00000532751 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 ERBB3P21860 1342 aa30.13■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.13■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 RTL1A6NKG5 1358 aa30.13■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 NSD2O96028 1365 aa30.13■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 WNK3Q9BYP7 1800 aa30.12■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 HOXC9P31274 260 aa30.11■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30.11■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.11■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
PTPRK-222ENST00000532751 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.07■■■□□ 2.4
PTPRK-222ENST00000532751 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.07■■■□□ 2.4
PTPRK-222ENST00000532751 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PTPRK-222ENST00000532751 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
PTPRK-222ENST00000532751 FLT4P35916 1363 aa30.04■■■□□ 2.4
PTPRK-222ENST00000532751 PDE3BQ13370 1112 aa30.04■■■□□ 2.4
PTPRK-222ENST00000532751 PEAK1Q9H792 1746 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRK-222ENST00000532751 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PTPRK-222ENST00000532751 MORC1Q86VD1 984 aa30.01■■■□□ 2.39
PTPRK-222ENST00000532751 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa30.01■■■□□ 2.39
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PTPRK-222ENST00000532751 INSRP06213 1382 aa30■■■□□ 2.39
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC37A3O60309 1634 aa30■■■□□ 2.39
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PTPRK-222ENST00000532751 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
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PTPRK-222ENST00000532751 POLKQ9UBT6 870 aa29.95■■■□□ 2.39
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PTPRK-222ENST00000532751 EXOC5O00471 708 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPRK-222ENST00000532751 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPRK-222ENST00000532751 EP400Q96L91 3159 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPRK-222ENST00000532751 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.9■■■□□ 2.38
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PTPRK-222ENST00000532751 NBPF4Q96M43 638 aa29.88■■■□□ 2.37
PTPRK-222ENST00000532751 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.88■■■□□ 2.37
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PTPRK-222ENST00000532751 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
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PTPRK-222ENST00000532751 TRIM37O94972 964 aa29.8■■■□□ 2.36
PTPRK-222ENST00000532751 BAG6P46379 1132 aa29.8■■■□□ 2.36
PTPRK-222ENST00000532751 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
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PTPRK-222ENST00000532751 EYA1Q99502 592 aa29.76■■■□□ 2.35
PTPRK-222ENST00000532751 NCAPD2Q15021 1401 aa29.75■■■□□ 2.35
PTPRK-222ENST00000532751 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.75■■■□□ 2.35
PTPRK-222ENST00000532751 MTHFSP49914 203 aa29.74■■■□□ 2.35
PTPRK-222ENST00000532751 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
PTPRK-222ENST00000532751 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.73■■■□□ 2.35
PTPRK-222ENST00000532751 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.72■■■□□ 2.35
PTPRK-222ENST00000532751 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
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