RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.26■■□□□ 1.79
TSTA3-211ENST00000529899 FAM182BQ5T319 152 aa26.24■■□□□ 1.79
TSTA3-211ENST00000529899 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.22■■□□□ 1.79
TSTA3-211ENST00000529899 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.22■■□□□ 1.79
TSTA3-211ENST00000529899 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.21■■□□□ 1.79
TSTA3-211ENST00000529899 SLC24A1O60721 1099 aa26.21■■□□□ 1.79
TSTA3-211ENST00000529899 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.21■■□□□ 1.79
TSTA3-211ENST00000529899 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.2■■□□□ 1.78
TSTA3-211ENST00000529899 FBLN1P23142 703 aa26.19■■□□□ 1.78
TSTA3-211ENST00000529899 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
TSTA3-211ENST00000529899 CRB1P82279 1406 aa26.19■■□□□ 1.78
TSTA3-211ENST00000529899 CDCA8Q53HL2 280 aa26.16■■□□□ 1.78
TSTA3-211ENST00000529899 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.16■■□□□ 1.78
TSTA3-211ENST00000529899 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.16■■□□□ 1.78
TSTA3-211ENST00000529899 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
TSTA3-211ENST00000529899 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.15■■□□□ 1.78
TSTA3-211ENST00000529899 ABCC6O95255 1503 aa26.14■■□□□ 1.78
TSTA3-211ENST00000529899 LRRC37A3O60309 1634 aa26.14■■□□□ 1.78
TSTA3-211ENST00000529899 BARGINQ6ZT62 677 aa26.14■■□□□ 1.78
TSTA3-211ENST00000529899 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.14■■□□□ 1.77
TSTA3-211ENST00000529899 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.14■■□□□ 1.77
TSTA3-211ENST00000529899 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
TSTA3-211ENST00000529899 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.13■■□□□ 1.77
TSTA3-211ENST00000529899 FYB1O15117 783 aa26.12■■□□□ 1.77
TSTA3-211ENST00000529899 COG3Q96JB2 828 aa26.11■■□□□ 1.77
TSTA3-211ENST00000529899 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TSTA3-211ENST00000529899 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.1■■□□□ 1.77
TSTA3-211ENST00000529899 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TSTA3-211ENST00000529899 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.08■■□□□ 1.77
TSTA3-211ENST00000529899 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.07■■□□□ 1.76
TSTA3-211ENST00000529899 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.07■■□□□ 1.76
TSTA3-211ENST00000529899 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.06■■□□□ 1.76
TSTA3-211ENST00000529899 PEAK1Q9H792 1746 aa26.06■■□□□ 1.76
TSTA3-211ENST00000529899 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
TSTA3-211ENST00000529899 ERBB3P21860 1342 aa26.06■■□□□ 1.76
TSTA3-211ENST00000529899 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
TSTA3-211ENST00000529899 DISP2A7MBM2 1401 aa26.05■■□□□ 1.76
TSTA3-211ENST00000529899 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.04■■□□□ 1.76
TSTA3-211ENST00000529899 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
TSTA3-211ENST00000529899 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.03■■□□□ 1.76
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC125Q86Z20 511 aa26.02■■□□□ 1.76
TSTA3-211ENST00000529899 HOXC9P31274 260 aa26■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 PDE3BQ13370 1112 aa26■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 IP6K1Q92551 441 aa26■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 NLRP2Q9NX02 1062 aa26■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 TRIM37O94972 964 aa25.98■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 PANK3Q9H999 370 aa25.98■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 SBF2Q86WG5 1849 aa25.98■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC7Q96M83 1385 aa25.97■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 AMPHP49418 695 aa25.97■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.96■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 DDB1Q16531 1140 aa25.96■■□□□ 1.75
TSTA3-211ENST00000529899 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.95■■□□□ 1.74
TSTA3-211ENST00000529899 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TSTA3-211ENST00000529899 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TSTA3-211ENST00000529899 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSTA3-211ENST00000529899 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.93■■□□□ 1.74
TSTA3-211ENST00000529899 RTL1A6NKG5 1358 aa25.93■■□□□ 1.74
TSTA3-211ENST00000529899 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.92■■□□□ 1.74
TSTA3-211ENST00000529899 TNS2Q63HR2 1409 aa25.92■■□□□ 1.74
TSTA3-211ENST00000529899 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.91■■□□□ 1.74
TSTA3-211ENST00000529899 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.91■■□□□ 1.74
TSTA3-211ENST00000529899 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.9■■□□□ 1.74
TSTA3-211ENST00000529899 BAG6P46379 1132 aa25.89■■□□□ 1.74
TSTA3-211ENST00000529899 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.88■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.88■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 IL2RBP14784 551 aa25.87■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 FLT4P35916 1363 aa25.86■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 MEGF6O75095 1541 aa25.86■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 APBA3O96018 575 aa25.85■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.85■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 NBPF4Q96M43 638 aa25.85■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 INSRP06213 1382 aa25.84■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 RREB1Q92766 1687 aa25.84■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 EXOC5O00471 708 aa25.84■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TSTA3-211ENST00000529899 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.82■■□□□ 1.72
TSTA3-211ENST00000529899 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.82■■□□□ 1.72
TSTA3-211ENST00000529899 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.81■■□□□ 1.72
TSTA3-211ENST00000529899 POLKQ9UBT6 870 aa25.81■■□□□ 1.72
TSTA3-211ENST00000529899 NHSQ6T4R5 1651 aa25.8■■□□□ 1.72
TSTA3-211ENST00000529899 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
TSTA3-211ENST00000529899 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.78■■□□□ 1.72
TSTA3-211ENST00000529899 BCL9O00512 1426 aa25.78■■□□□ 1.72
TSTA3-211ENST00000529899 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
TSTA3-211ENST00000529899 KCNQ2O43526 872 aa25.77■■□□□ 1.72
TSTA3-211ENST00000529899 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.77■■□□□ 1.72
TSTA3-211ENST00000529899 NSD2O96028 1365 aa25.76■■□□□ 1.71
TSTA3-211ENST00000529899 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.76■■□□□ 1.71
TSTA3-211ENST00000529899 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
TSTA3-211ENST00000529899 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
TSTA3-211ENST00000529899 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.75■■□□□ 1.71
TSTA3-211ENST00000529899 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.74■■□□□ 1.71
TSTA3-211ENST00000529899 BTAF1O14981 1849 aa25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms