RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491843.2

ZNF638-222, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 3

Gene ZNF638, Length 332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-222	ENST00000491843	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	GPR37L1	O60883	481 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	FBXO45	P0C2W1	286 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	RAB15	P59190	212 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	APBB1	O00213	710 aa		10.71	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
ZNF638-222	ENST00000491843	SOCS7	O14512	581 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	TRIM47	Q96LD4	638 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	SENP2	Q9HC62	589 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	ZFP42	Q96MM3	310 aa		10.69	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		10.69	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	NR1H3	Q13133	447 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	CBLB	Q13191	982 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	KIFC2	Q96AC6	838 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	SCARF1	Q14162	830 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	MCM6	Q14566	821 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	MEIOB	Q8N635	442 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZNF638-222	ENST00000491843	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	ESPN	B1AK53	854 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	BMP2	P12643	396 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	ABL2	P42684	1182 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	UPP2	O95045	317 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	IRF5	Q13568	498 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	SOBP	A7XYQ1	873 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
ZNF638-222	ENST00000491843		Q6ZVU0	165 aa		10.58	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	CYLD	Q9NQC7	956 aa		10.58	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	RELB	Q01201	579 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	VAC14	Q08AM6	782 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	LILRA1	O75019	489 aa		10.56	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	10.55	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	POM121	Q96HA1	1249 aa		10.55	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	COG6	Q9Y2V7	657 aa		10.55	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	MAN1A2	O60476	641 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	RNF20	Q5VTR2	975 aa		10.53	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF592	Q92610	1267 aa		10.53	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		10.53	□□□□□ -0.72
ZNF638-222	ENST00000491843	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	10.52	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		10.52	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	SPINT1	O43278	529 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	ADH1A	P07327	375 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	VEGFB	P49765	207 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	TREML4	Q6UXN2	200 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	TTLL8	A6PVC2	850 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	SCTR	P47872	440 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	FLII	Q13045	1269 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	WFS1	O76024	890 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	WASHC4	Q2M389	1173 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	RAD21	O60216	631 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	PTGIR	P43119	386 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	ERVK-9	P63128	1117 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	CCDC125	Q86Z20	511 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
ZNF638-222	ENST00000491843	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ZNF638-222	ENST00000491843	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ZNF638-222	ENST00000491843	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF638-222	ENST00000491843	LCE2C	Q5TA81	110 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF638-222	ENST00000491843	RNF135	Q8IUD6	432 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF638-222	ENST00000491843	TRIM52	Q96A61	297 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF638-222	ENST00000491843	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74

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