RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GTF3C4-202ENST00000483873 EVA1CP58658 441 aa36.6■■■■□ 3.45
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GTF3C4-202ENST00000483873 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.51■■■■□ 3.43
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GTF3C4-202ENST00000483873 PEAK1Q9H792 1746 aa36.44■■■■□ 3.42
GTF3C4-202ENST00000483873 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa36.43■■■■□ 3.42
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GTF3C4-202ENST00000483873 ERBB3P21860 1342 aa36.41■■■■□ 3.42
GTF3C4-202ENST00000483873 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
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GTF3C4-202ENST00000483873 AMPHP49418 695 aa36.4■■■■□ 3.42
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GTF3C4-202ENST00000483873 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP36.39■■■■□ 3.42
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GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD24Q8TF21 1146 aa36.38■■■■□ 3.41
GTF3C4-202ENST00000483873 KNSTRNQ9Y448 316 aa36.38■■■■□ 3.41
GTF3C4-202ENST00000483873 RTL1A6NKG5 1358 aa36.36■■■■□ 3.41
GTF3C4-202ENST00000483873 RGPD2P0DJD1 1756 aa36.36■■■■□ 3.41
GTF3C4-202ENST00000483873 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
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GTF3C4-202ENST00000483873 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.33■■■■□ 3.41
GTF3C4-202ENST00000483873 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa36.33■■■■□ 3.41
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GTF3C4-202ENST00000483873 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa36.13■■■■□ 3.37
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GTF3C4-202ENST00000483873 TATP17735 454 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
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GTF3C4-202ENST00000483873 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
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