RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 CPDO75976 1380 aa12.27□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 RGPD1P0DJD0 1748 aa12.26□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 NLRP6P59044 892 aa12.25□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 AXIN2Q9Y2T1 843 aa12.25□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 PARD3Q8TEW0 1356 aa12.25□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa12.24□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 KCNQ2O43526 872 aa12.23□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 SPON1Q9HCB6 807 aa12.22□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 NRKQ7Z2Y5 1582 aa12.22□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 PLSCR1O15162 318 aa12.21□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 YY1P25490 414 aa12.21□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 DDB1Q16531 1140 aa12.21□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa12.21□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CTPS1-208ENST00000479480 CRB1P82279 1406 aa12.2□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 AATKQ6ZMQ8 1374 aa12.2□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 LMO7Q8WWI1 1683 aa12.2□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.2□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 SOX12O15370 315 aa12.19□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGEF25Q86VW2 580 aa12.19□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 ITSN1Q15811 1721 aa12.19□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa12.19□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 USP6P35125 1406 aa12.19□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa12.18□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 SIN3AQ96ST3 1273 aa12.18□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 WDR17Q8IZU2 1322 aa12.16□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB7AO95365 584 aa12.16□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa12.16□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa12.16□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 OVOS2Q6IE36 1432 aa12.16□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 NUP188Q5SRE5 1749 aa12.16□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 RREB1Q92766 1687 aa12.16□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 EVC2Q86UK5 1308 aa12.15□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 EXOC5O00471 708 aa12.15□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 TXNRD1Q16881 649 aa12.15□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 CARD10Q9BWT7 1032 aa12.15□□□□□ -0.46
CTPS1-208ENST00000479480 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa12.14□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 PTGER2P43116 358 aa12.14□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 SLIT3O75094 1523 aa12.14□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.13□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 PEAK1Q9H792 1746 aa12.13□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa12.13□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 NEUROD1Q13562 356 aa12.12□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 SLC15A2Q16348 729 aa12.12□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.12□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 COL18A1P39060 1754 aa12.12□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 NINLQ9Y2I6 1382 aa12.11□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 STK32BQ9NY57 414 aa12.11□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 BCL9O00512 1426 aa12.11□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 SYT17Q9BSW7 474 aa12.1□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 TTC21AQ8NDW8 1320 aa12.1□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 NME9Q86XW9 330 aa12.09□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 SGIP1Q9BQI5 828 aa12.09□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC37A3O60309 1634 aa12.08□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 PIK3C2AO00443 1686 aa12.08□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 NLRP2Q9NX02 1062 aa12.08□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa12.07□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC4BQ9NT99 713 aa12.07□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 QRICH2Q9H0J4 1663 aa12.06□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC7Q96M83 1385 aa12.06□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD24Q8TF21 1146 aa12.06□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 MTFR1LQ9H019 292 aa12.06□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 SBF2Q86WG5 1849 aa12.06□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 USP31Q70CQ4 1352 aa12.05□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 IL2RBP14784 551 aa12.05□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF827Q17R98 1081 aa12.05□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 TMC1Q8TDI8 760 aa12.05□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 AKT1S1Q96B36 256 aa12.05□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 NFAT5O94916 1531 aa12.05□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 CASZ1Q86V15 1759 aa12.05□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 ERBB3P21860 1342 aa12.04□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa12.04□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 FBLN1P23142 703 aa12.03□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 KCNQ4P56696 695 aa12.03□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 ARXQ96QS3 562 aa12.03□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 RGPD5Q99666 1765 aa12.02□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 CD163L1Q9NR16 1453 aa12.02□□□□□ -0.48
CTPS1-208ENST00000479480 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
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