RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464931.1

USP19-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, humanhuman

TSL 3

Gene USP19, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19-209ENST00000464931 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
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USP19-209ENST00000464931 USP35Q9P2H5 1018 aa23.3■■□□□ 1.32
USP19-209ENST00000464931 CRB1P82279 1406 aa23.3■■□□□ 1.32
USP19-209ENST00000464931 CCDC125Q86Z20 511 aa23.29■■□□□ 1.32
USP19-209ENST00000464931 COL18A1P39060 1754 aa23.29■■□□□ 1.32
USP19-209ENST00000464931 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.28■■□□□ 1.32
USP19-209ENST00000464931 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.28■■□□□ 1.32
USP19-209ENST00000464931 MYOM1P52179 1685 aa23.28■■□□□ 1.32
USP19-209ENST00000464931 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.28■■□□□ 1.32
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USP19-209ENST00000464931 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.25■■□□□ 1.31
USP19-209ENST00000464931 LTN1O94822 1766 aa23.23■■□□□ 1.31
USP19-209ENST00000464931 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.23■■□□□ 1.31
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USP19-209ENST00000464931 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.21■■□□□ 1.31
USP19-209ENST00000464931 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.21■■□□□ 1.31
USP19-209ENST00000464931 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.21■■□□□ 1.31
USP19-209ENST00000464931 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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USP19-209ENST00000464931 RGPD5Q99666 1765 aa23.19■■□□□ 1.3
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USP19-209ENST00000464931 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
USP19-209ENST00000464931 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.17■■□□□ 1.3
USP19-209ENST00000464931 RTL1A6NKG5 1358 aa23.16■■□□□ 1.3
USP19-209ENST00000464931 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.16■■□□□ 1.3
USP19-209ENST00000464931 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.16■■□□□ 1.3
USP19-209ENST00000464931 PANK3Q9H999 370 aa23.15■■□□□ 1.3
USP19-209ENST00000464931 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.15■■□□□ 1.3
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USP19-209ENST00000464931 DDB1Q16531 1140 aa23.13■■□□□ 1.29
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USP19-209ENST00000464931 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.1■■□□□ 1.29
USP19-209ENST00000464931 EP400Q96L91 3159 aa23.09■■□□□ 1.29
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USP19-209ENST00000464931 FAM182BQ5T319 152 aa23.09■■□□□ 1.29
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USP19-209ENST00000464931 TNS2Q63HR2 1409 aa23.02■■□□□ 1.28
USP19-209ENST00000464931 TRIM37O94972 964 aa23.02■■□□□ 1.28
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USP19-209ENST00000464931 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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USP19-209ENST00000464931 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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USP19-209ENST00000464931 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.89■■□□□ 1.25
USP19-209ENST00000464931 SBF2Q86WG5 1849 aa22.88■■□□□ 1.25
USP19-209ENST00000464931 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.88■■□□□ 1.25
USP19-209ENST00000464931 MEGF6O75095 1541 aa22.87■■□□□ 1.25
USP19-209ENST00000464931 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
USP19-209ENST00000464931 PLSCR1O15162 318 aa22.86■■□□□ 1.25
USP19-209ENST00000464931 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP19-209ENST00000464931 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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