RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
CERS1-201ENST00000429504 DIP2AQ14689 1571 aa35.31■■■■□ 3.24
CERS1-201ENST00000429504 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa35.3■■■■□ 3.24
CERS1-201ENST00000429504 OVOS2Q6IE36 1432 aa35.3■■■■□ 3.24
CERS1-201ENST00000429504 PTCH1Q13635 1447 aa35.3■■■■□ 3.24
CERS1-201ENST00000429504 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CERS1-201ENST00000429504 DDX19BQ9UMR2 479 aa35.29■■■■□ 3.24
CERS1-201ENST00000429504 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.29■■■■□ 3.24
CERS1-201ENST00000429504 USP6P35125 1406 aa35.29■■■■□ 3.24
CERS1-201ENST00000429504 ACEP12821 1306 aa35.28■■■■□ 3.24
CERS1-201ENST00000429504 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
CERS1-201ENST00000429504 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
CERS1-201ENST00000429504 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
CERS1-201ENST00000429504 LMOD3Q0VAK6 560 aa35.25■■■■□ 3.23
CERS1-201ENST00000429504 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.25■■■■□ 3.23
CERS1-201ENST00000429504 IFT57Q9NWB7 429 aa35.25■■■■□ 3.23
CERS1-201ENST00000429504 TBX22Q9Y458 520 aa35.25■■■■□ 3.23
CERS1-201ENST00000429504 GNAI1P63096 354 aa35.24■■■■□ 3.23
CERS1-201ENST00000429504 NBR1Q14596 966 aa35.21■■■■□ 3.23
CERS1-201ENST00000429504 ITPRIPQ8IWB1 547 aa35.21■■■■□ 3.23
CERS1-201ENST00000429504 ZNF853P0CG23 659 aa35.21■■■■□ 3.23
CERS1-201ENST00000429504 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa35.21■■■■□ 3.23
CERS1-201ENST00000429504 SSH2Q76I76 1423 aa35.21■■■■□ 3.23
CERS1-201ENST00000429504 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
CERS1-201ENST00000429504 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.2■■■■□ 3.23
CERS1-201ENST00000429504 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 USP31Q70CQ4 1352 aa35.19■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 PEAK1Q9H792 1746 aa35.18■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 RGPD1P0DJD0 1748 aa35.18■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 TMEM57Q8N5G2 664 aa35.17■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 VAMP4O75379 141 aa35.15■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 CFAP44Q96MT7 982 aa35.14■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 MBIPQ9NS73 344 aa35.13■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa35.13■■■■□ 3.22
CERS1-201ENST00000429504 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.13■■■■□ 3.21
CERS1-201ENST00000429504 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.13■■■■□ 3.21
CERS1-201ENST00000429504 NUTM2FA1L443 756 aa35.13■■■■□ 3.21
CERS1-201ENST00000429504 ARHGAP45Q92619 1136 aa35.12■■■■□ 3.21
CERS1-201ENST00000429504 PIK3R4Q99570 1358 aa35.09■■■■□ 3.21
CERS1-201ENST00000429504 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
CERS1-201ENST00000429504 USP19O94966 1318 aa35.08■■■■□ 3.21
CERS1-201ENST00000429504 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
CERS1-201ENST00000429504 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.07■■■■□ 3.2
CERS1-201ENST00000429504 TSPYL6Q8N831 410 aa35.07■■■■□ 3.2
CERS1-201ENST00000429504 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
CERS1-201ENST00000429504 SULT6B1Q6IMI4 303 aa35.05■■■■□ 3.2
CERS1-201ENST00000429504 SMC5Q8IY18 1101 aa35.05■■■■□ 3.2
CERS1-201ENST00000429504 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
CERS1-201ENST00000429504 AEBP1Q8IUX7 1158 aa35.04■■■■□ 3.2
CERS1-201ENST00000429504 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.04■■■■□ 3.2
CERS1-201ENST00000429504 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
CERS1-201ENST00000429504 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
CERS1-201ENST00000429504 FAM83GA6ND36 823 aa35.02■■■■□ 3.2
CERS1-201ENST00000429504 PIK3C2AO00443 1686 aa35.02■■■■□ 3.2
CERS1-201ENST00000429504 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa35.01■■■■□ 3.19
CERS1-201ENST00000429504 USP35Q9P2H5 1018 aa35.01■■■■□ 3.19
CERS1-201ENST00000429504 ARHGEF10O15013 1369 aa35■■■■□ 3.19
CERS1-201ENST00000429504 SEC24BO95487 1268 aa35■■■■□ 3.19
CERS1-201ENST00000429504 ABCC4O15439 1325 aa34.98■■■■□ 3.19
CERS1-201ENST00000429504 SBNO1A3KN83 1393 aa34.98■■■■□ 3.19
CERS1-201ENST00000429504 C8orf58Q8NAV2 365 aa34.97■■■■□ 3.19
CERS1-201ENST00000429504 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
CERS1-201ENST00000429504 FLT4P35916 1363 aa34.97■■■■□ 3.19
CERS1-201ENST00000429504 USP54Q70EL1 1684 aa34.97■■■■□ 3.19
CERS1-201ENST00000429504 MAP3K19Q56UN5 1328 aa34.96■■■■□ 3.19
CERS1-201ENST00000429504 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.96■■■■□ 3.19
CERS1-201ENST00000429504 DCTN1Q14203 1278 aa34.96■■■■□ 3.19
CERS1-201ENST00000429504 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 SLC4A3P48751 1232 aa34.94■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 KCNA6P17658 529 aa34.91■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 KDRP35968 1356 aa34.9■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 CHL1O00533 1208 aa34.9■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 DEKP35659 375 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 KIAA0232Q92628 1395 aa34.89■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
CERS1-201ENST00000429504 NUCB1Q02818 461 aa34.88■■■■□ 3.17
CERS1-201ENST00000429504 KIF24Q5T7B8 1368 aa34.88■■■■□ 3.17
CERS1-201ENST00000429504 SOX12O15370 315 aa34.88■■■■□ 3.17
CERS1-201ENST00000429504 TBC1D32Q96NH3 1257 aa34.87■■■■□ 3.17
CERS1-201ENST00000429504 CRB1P82279 1406 aa34.84■■■■□ 3.17
CERS1-201ENST00000429504 MCM10Q7L590 875 aa34.83■■■■□ 3.17
CERS1-201ENST00000429504 IGSF1Q8N6C5 1336 aa34.83■■■■□ 3.17
CERS1-201ENST00000429504 GCC1Q96CN9 775 aa34.83■■■■□ 3.17
CERS1-201ENST00000429504 AMPHP49418 695 aa34.81■■■■□ 3.16
CERS1-201ENST00000429504 BECN1Q14457 450 aa34.8■■■■□ 3.16
CERS1-201ENST00000429504 CHD1LQ86WJ1 897 aa34.8■■■■□ 3.16
CERS1-201ENST00000429504 NLRP6P59044 892 aa34.78■■■■□ 3.16
CERS1-201ENST00000429504 EYA1Q99502 592 aa34.77■■■■□ 3.16
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