RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 FLT4P35916 1363 aa44.91■■■■■ 4.78
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CSNK1E-204ENST00000403904 KIF24Q5T7B8 1368 aa44.9■■■■■ 4.78
CSNK1E-204ENST00000403904 RTL1A6NKG5 1358 aa44.9■■■■■ 4.78
CSNK1E-204ENST00000403904 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa44.89■■■■■ 4.78
CSNK1E-204ENST00000403904 LMO7Q8WWI1 1683 aa44.88■■■■■ 4.77
CSNK1E-204ENST00000403904 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP44.87■■■■■ 4.77
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CSNK1E-204ENST00000403904 NGLY1Q96IV0 654 aa44.85■■■■■ 4.77
CSNK1E-204ENST00000403904 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa44.85■■■■■ 4.77
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CSNK1E-204ENST00000403904 PLCH1Q4KWH8 1693 aa44.84■■■■■ 4.77
CSNK1E-204ENST00000403904 BTG4Q9NY30 223 aa44.83■■■■■ 4.77
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CSNK1E-204ENST00000403904 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
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CSNK1E-204ENST00000403904 USP21Q9UK80 565 aa44.66■■■■■ 4.74
CSNK1E-204ENST00000403904 MRS2Q9HD23 443 aa44.65■■■■■ 4.74
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CSNK1E-204ENST00000403904 RGPD2P0DJD1 1756 aa44.64■■■■■ 4.74
CSNK1E-204ENST00000403904 CCER2I3L3R5 266 aa44.6■■■■■ 4.73
CSNK1E-204ENST00000403904 NLRP2Q9NX02 1062 aa44.59■■■■■ 4.73
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CSNK1E-204ENST00000403904 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
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CSNK1E-204ENST00000403904 NBPF4Q96M43 638 aa44.57■■■■■ 4.73
CSNK1E-204ENST00000403904 EYA1Q99502 592 aa44.57■■■■■ 4.73
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CSNK1E-204ENST00000403904 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa44.45■■■■■ 4.71
CSNK1E-204ENST00000403904 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa44.45■■■■■ 4.71
CSNK1E-204ENST00000403904 HMOX1P09601 288 aa44.44■■■■■ 4.71
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CSNK1E-204ENST00000403904 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP44.44■■■■■ 4.71
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CSNK1E-204ENST00000403904 PRKAR2BP31323 418 aa44.27■■■■■ 4.68
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CSNK1E-204ENST00000403904 BARGINQ6ZT62 677 aa44.26■■■■■ 4.68
CSNK1E-204ENST00000403904 POTEAQ6S8J7 498 aa44.26■■■■■ 4.68
CSNK1E-204ENST00000403904 TATP17735 454 aaPredicted RBP44.23■■■■■ 4.67
CSNK1E-204ENST00000403904 DISP2A7MBM2 1401 aa44.23■■■■■ 4.67
CSNK1E-204ENST00000403904 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
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CSNK1E-204ENST00000403904 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
CSNK1E-204ENST00000403904 PLEKHF1Q96S99 279 aa44.2■■■■■ 4.67
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