RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376504.3

PTF1A-201, Transcript of pancreas associated transcription factor 1a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTF1A, Length 1,537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1A-201ENST00000376504 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
PTF1A-201ENST00000376504 ABCC6O95255 1503 aa42.7■■■■■ 4.43
PTF1A-201ENST00000376504 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
PTF1A-201ENST00000376504 FAM9BQ8IZU0 186 aa42.69■■■■■ 4.42
PTF1A-201ENST00000376504 IL13P35225 146 aa42.66■■■■■ 4.42
PTF1A-201ENST00000376504 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
PTF1A-201ENST00000376504 LMO7Q8WWI1 1683 aa42.65■■■■■ 4.42
PTF1A-201ENST00000376504 CHRNA2Q15822 529 aa42.64■■■■■ 4.42
PTF1A-201ENST00000376504 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.42
PTF1A-201ENST00000376504 AXIN2Q9Y2T1 843 aa42.63■■■■■ 4.42
PTF1A-201ENST00000376504 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP42.62■■■■■ 4.41
PTF1A-201ENST00000376504 PRDM11Q9NQV5 511 aa42.62■■■■■ 4.41
PTF1A-201ENST00000376504 RGPD1P0DJD0 1748 aa42.62■■■■■ 4.41
PTF1A-201ENST00000376504 NUDCQ9Y266 331 aa42.61■■■■■ 4.41
PTF1A-201ENST00000376504 ADAMTS8Q9UP79 889 aa42.6■■■■■ 4.41
PTF1A-201ENST00000376504 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
PTF1A-201ENST00000376504 FAM83GA6ND36 823 aa42.56■■■■■ 4.4
PTF1A-201ENST00000376504 RGPD2P0DJD1 1756 aa42.56■■■■■ 4.4
PTF1A-201ENST00000376504 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa42.55■■■■■ 4.4
PTF1A-201ENST00000376504 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
PTF1A-201ENST00000376504 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
PTF1A-201ENST00000376504 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
PTF1A-201ENST00000376504 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
PTF1A-201ENST00000376504 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa42.53■■■■■ 4.4
PTF1A-201ENST00000376504 FBXO41Q8TF61 875 aa42.53■■■■■ 4.4
PTF1A-201ENST00000376504 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
PTF1A-201ENST00000376504 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
PTF1A-201ENST00000376504 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP42.51■■■■■ 4.4
PTF1A-201ENST00000376504 ANKRD24Q8TF21 1146 aa42.51■■■■■ 4.39
PTF1A-201ENST00000376504 ADAMTS2O95450 1211 aa42.49■■■■■ 4.39
PTF1A-201ENST00000376504 LRP6O75581 1613 aa42.49■■■■■ 4.39
PTF1A-201ENST00000376504 ERBB3P21860 1342 aa42.49■■■■■ 4.39
PTF1A-201ENST00000376504 PLCH1Q4KWH8 1693 aa42.48■■■■■ 4.39
PTF1A-201ENST00000376504 EYA1Q99502 592 aa42.46■■■■■ 4.39
PTF1A-201ENST00000376504 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
PTF1A-201ENST00000376504 IGSF1Q8N6C5 1336 aa42.45■■■■■ 4.39
PTF1A-201ENST00000376504 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
PTF1A-201ENST00000376504 HMOX1P09601 288 aa42.4■■■■■ 4.38
PTF1A-201ENST00000376504 NBPF6Q5VWK0 638 aa42.4■■■■■ 4.38
PTF1A-201ENST00000376504 NBPF4Q96M43 638 aa42.4■■■■■ 4.38
PTF1A-201ENST00000376504 RSPH6AQ9H0K4 717 aa42.4■■■■■ 4.38
PTF1A-201ENST00000376504 AEBP1Q8IUX7 1158 aa42.39■■■■■ 4.38
PTF1A-201ENST00000376504 NRAPQ86VF7 1730 aa42.39■■■■■ 4.38
PTF1A-201ENST00000376504 NCAPD2Q15021 1401 aa42.39■■■■■ 4.38
PTF1A-201ENST00000376504 BTG4Q9NY30 223 aa42.38■■■■■ 4.37
PTF1A-201ENST00000376504 NWD2Q9ULI1 1742 aa42.38■■■■■ 4.37
PTF1A-201ENST00000376504 FCHSD2O94868 740 aa42.37■■■■■ 4.37
PTF1A-201ENST00000376504 SULT6B1Q6IMI4 303 aa42.37■■■■■ 4.37
PTF1A-201ENST00000376504 CCDC146Q8IYE0 955 aa42.37■■■■■ 4.37
PTF1A-201ENST00000376504 KDRP35968 1356 aa42.37■■■■■ 4.37
PTF1A-201ENST00000376504 PLEKHF1Q96S99 279 aa42.35■■■■■ 4.37
PTF1A-201ENST00000376504 WDR17Q8IZU2 1322 aa42.34■■■■■ 4.37
PTF1A-201ENST00000376504 SLIT2O94813 1529 aa42.34■■■■■ 4.37
PTF1A-201ENST00000376504 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
PTF1A-201ENST00000376504 USHBP1Q8N6Y0 703 aa42.33■■■■■ 4.37
PTF1A-201ENST00000376504 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa42.32■■■■■ 4.37
PTF1A-201ENST00000376504 RUNDC1Q96C34 613 aa42.31■■■■■ 4.36
PTF1A-201ENST00000376504 PRKAR2BP31323 418 aa42.3■■■■■ 4.36
PTF1A-201ENST00000376504 STRN4Q9NRL3 753 aa42.3■■■■■ 4.36
PTF1A-201ENST00000376504 NLRP2Q9NX02 1062 aa42.28■■■■■ 4.36
PTF1A-201ENST00000376504 EVA1CP58658 441 aa42.27■■■■■ 4.36
PTF1A-201ENST00000376504 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
PTF1A-201ENST00000376504 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
PTF1A-201ENST00000376504 C8orf37Q96NL8 207 aa42.26■■■■■ 4.36
PTF1A-201ENST00000376504 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP42.25■■■■■ 4.35
PTF1A-201ENST00000376504 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa42.23■■■■■ 4.35
PTF1A-201ENST00000376504 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa42.22■■■■■ 4.35
PTF1A-201ENST00000376504 NGLY1Q96IV0 654 aa42.22■■■■■ 4.35
PTF1A-201ENST00000376504 CRB1P82279 1406 aa42.21■■■■■ 4.35
PTF1A-201ENST00000376504 PHACTR3Q96KR7 559 aa42.21■■■■■ 4.35
PTF1A-201ENST00000376504 APAF1O14727 1248 aa42.2■■■■■ 4.35
PTF1A-201ENST00000376504 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
PTF1A-201ENST00000376504 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
PTF1A-201ENST00000376504 CARD10Q9BWT7 1032 aa42.2■■■■■ 4.35
PTF1A-201ENST00000376504 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
PTF1A-201ENST00000376504 TCP11L2Q8N4U5 519 aa42.19■■■■■ 4.34
PTF1A-201ENST00000376504 BCL9LQ86UU0 1499 aa42.18■■■■■ 4.34
PTF1A-201ENST00000376504 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa42.18■■■■■ 4.34
PTF1A-201ENST00000376504 UNC5CLQ8IV45 518 aa42.14■■■■■ 4.34
PTF1A-201ENST00000376504 DLG5Q8TDM6 1919 aa42.14■■■■■ 4.34
PTF1A-201ENST00000376504 MEGF6O75095 1541 aa42.12■■■■■ 4.33
PTF1A-201ENST00000376504 NEFMP07197 916 aa42.11■■■■■ 4.33
PTF1A-201ENST00000376504 TMPOP42166 694 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
PTF1A-201ENST00000376504 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
PTF1A-201ENST00000376504 WNK3Q9BYP7 1800 aa42.08■■■■■ 4.33
PTF1A-201ENST00000376504 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
PTF1A-201ENST00000376504 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
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PTF1A-201ENST00000376504 NFE2L2Q16236 605 aa42.06■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 USP21Q9UK80 565 aa42.06■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa42.05■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 ZBED9Q6R2W3 1325 aa42.05■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa42.04■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 PKD1L3Q7Z443 1732 aa42.04■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 USP35Q9P2H5 1018 aa42.04■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa42.04■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa42.04■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 NEUROD2Q15784 382 aa42.03■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa42.03■■■■■ 4.32
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