RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 PEAK1Q9H792 1746 aa26.52■■□□□ 1.84
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KCNQ1-202ENST00000335475 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.52■■□□□ 1.84
KCNQ1-202ENST00000335475 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.51■■□□□ 1.84
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KCNQ1-202ENST00000335475 DIP2AQ14689 1571 aa26.5■■□□□ 1.83
KCNQ1-202ENST00000335475 SSH2Q76I76 1423 aa26.5■■□□□ 1.83
KCNQ1-202ENST00000335475 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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KCNQ1-202ENST00000335475 TBX22Q9Y458 520 aa26.43■■□□□ 1.82
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KCNQ1-202ENST00000335475 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
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KCNQ1-202ENST00000335475 USP35Q9P2H5 1018 aa26.3■■□□□ 1.8
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGEF10O15013 1369 aa26.3■■□□□ 1.8
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KCNQ1-202ENST00000335475 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.28■■□□□ 1.8
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KCNQ1-202ENST00000335475 SBNO1A3KN83 1393 aa26.27■■□□□ 1.8
KCNQ1-202ENST00000335475 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.26■■□□□ 1.79
KCNQ1-202ENST00000335475 FLT4P35916 1363 aa26.26■■□□□ 1.79
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KCNQ1-202ENST00000335475 CRB1P82279 1406 aa26.24■■□□□ 1.79
KCNQ1-202ENST00000335475 CHL1O00533 1208 aa26.22■■□□□ 1.79
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KCNQ1-202ENST00000335475 LRRC37A3O60309 1634 aa26.19■■□□□ 1.78
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KCNQ1-202ENST00000335475 NFKBIBQ15653 356 aa26.18■■□□□ 1.78
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT24Q2M2I5 525 aa26.17■■□□□ 1.78
KCNQ1-202ENST00000335475 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.17■■□□□ 1.78
KCNQ1-202ENST00000335475 NWD1Q149M9 1564 aa26.17■■□□□ 1.78
KCNQ1-202ENST00000335475 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.16■■□□□ 1.78
KCNQ1-202ENST00000335475 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.16■■□□□ 1.78
KCNQ1-202ENST00000335475 LNPKQ9C0E8 428 aa26.15■■□□□ 1.78
KCNQ1-202ENST00000335475 GCC1Q96CN9 775 aa26.14■■□□□ 1.78
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