RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 FILIP1LQ4L180 1135 aa26.64■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 HSP90B2PQ58FF3 399 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 PAF1Q8N7H5 531 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 SPC24Q8NBT2 197 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 BTBD11A6QL63 1104 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 SYCP1Q15431 976 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 AACSQ86V21 672 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 RABEP1Q15276 862 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 NACAP1Q9BZK3 213 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 SMARCE1Q969G3 411 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 PDCP20941 246 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 MRE11P49959 708 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 GRIN2BQ13224 1484 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRM-201ENST00000332175 MCM2P49736 904 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM22Q8IYM9 498 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINC1P01008 464 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 ME1P48163 572 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 RAPGEF3O95398 923 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 ERBINQ96RT1 1412 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 SRGAP3O43295 1099 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 SOGA3Q5TF21 947 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 AKNAQ7Z591 1439 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 MBD3O95983 291 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 RAI14Q9P0K7 980 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 TDO2P48775 406 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 RDXP35241 583 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 MPNDQ8N594 471 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 PDCL3Q9H2J4 239 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 PDE3AQ14432 1141 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRM-201ENST00000332175 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 MYO6Q9UM54 1294 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD1Q15327 319 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 TNMDQ9H2S6 317 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 JMYQ8N9B5 988 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 HFM1A2PYH4 1435 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 DEF6Q9H4E7 631 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 LRP2BPQ9P2M1 347 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 WDR63Q8IWG1 891 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 PPFIBP1Q86W92 1011 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 USP5P45974 858 aa26.45■■□□□ 1.83
PTPRM-201ENST00000332175 STIM1Q13586 685 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.822e-6■■■■□ 20.7
PTPRM-201ENST00000332175 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 CCP110O43303 1012 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC192P0DO97 292 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF76P36508 570 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 MAP7D2Q96T17 732 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 DACH1Q9UI36 760 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 ARAP1Q96P48 1450 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 ABCF2Q9UG63 623 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 KRT85P78386 507 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRM-201ENST00000332175 MCM10Q7L590 875 aa26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms