RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa36.52■■■■□ 3.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL13P35225 146 aa36.51■■■■□ 3.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPDO75976 1380 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHPRHQ149N8 1683 aa36.49■■■■□ 3.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA0232Q92628 1395 aa36.48■■■■□ 3.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.48■■■■□ 3.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 JCADQ9P266 1359 aa36.45■■■■□ 3.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCA3Q99758 1704 aa36.44■■■■□ 3.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHRNA2Q15822 529 aa36.43■■■■□ 3.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSPA1LP34931 641 aa36.42■■■■□ 3.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP36.42■■■■□ 3.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCC6O95255 1503 aa36.39■■■■□ 3.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD24Q8TF21 1146 aa36.38■■■■□ 3.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 AXIN2Q9Y2T1 843 aa36.38■■■■□ 3.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC146Q8IYE0 955 aa36.37■■■■□ 3.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCHSD2O94868 740 aa36.36■■■■□ 3.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEFMP07197 916 aa36.34■■■■□ 3.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 HMOX1P09601 288 aa36.34■■■■□ 3.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 RUNDC1Q96C34 613 aa36.34■■■■□ 3.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 EYA1Q99502 592 aa36.33■■■■□ 3.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 SULT6B1Q6IMI4 303 aa36.32■■■■□ 3.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM83GA6ND36 823 aa36.31■■■■□ 3.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa36.31■■■■□ 3.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAMTS2O95450 1211 aa36.3■■■■□ 3.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERBB3P21860 1342 aa36.3■■■■□ 3.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGSF1Q8N6C5 1336 aa36.3■■■■□ 3.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa36.3■■■■□ 3.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL18A1P39060 1754 aa36.3■■■■□ 3.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 RSPH6AQ9H0K4 717 aa36.29■■■■□ 3.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.29■■■■□ 3.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKAR2BP31323 418 aa36.28■■■■□ 3.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 EVA1CP58658 441 aa36.25■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGPD1P0DJD0 1748 aa36.25■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 NBPF6Q5VWK0 638 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 AEBP1Q8IUX7 1158 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 NBPF4Q96M43 638 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGPD5Q99666 1765 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 APAF1O14727 1248 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHF1Q96S99 279 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 NLRP2Q9NX02 1062 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa36.23■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 BTG4Q9NY30 223 aa36.22■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 LMO7Q8WWI1 1683 aa36.22■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36.22■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.2■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 USHBP1Q8N6Y0 703 aa36.2■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 KDRP35968 1356 aa36.2■■■■□ 3.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 STRN4Q9NRL3 753 aa36.19■■■■□ 3.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR17Q8IZU2 1322 aa36.18■■■■□ 3.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 NGEFQ8N5V2 710 aa36.18■■■■□ 3.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBED9Q6R2W3 1325 aa36.17■■■■□ 3.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa36.17■■■■□ 3.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO41Q8TF61 875 aa36.15■■■■□ 3.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEUROD2Q15784 382 aa36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHACTR3Q96KR7 559 aa36.12■■■■□ 3.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 C8orf37Q96NL8 207 aa36.11■■■■□ 3.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMPOP42166 694 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 NGLY1Q96IV0 654 aa36.1■■■■□ 3.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 NCAPD2Q15021 1401 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGPD2P0DJD1 1756 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFE2L2Q16236 605 aa36.08■■■■□ 3.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RIPK4P57078 832 aa36.05■■■■□ 3.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRB1P82279 1406 aa36.04■■■■□ 3.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAS2L2Q8NHY3 880 aa36.03■■■■□ 3.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TATP17735 454 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLIT2O94813 1529 aa36.01■■■■□ 3.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-201ENST00000318988 AMOTQ4VCS5 1084 aa35.99■■■■□ 3.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
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CTDNEP1-201ENST00000318988 USP35Q9P2H5 1018 aa35.98■■■■□ 3.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.98■■■■□ 3.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 WWC1Q8IX03 1113 aa35.98■■■■□ 3.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDE3BQ13370 1112 aa35.96■■■■□ 3.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 NRAPQ86VF7 1730 aa35.93■■■■□ 3.34
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