RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.36■■■□□ 2.29
CITED1-201ENST00000246139 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.36■■■□□ 2.29
CITED1-201ENST00000246139 SLIT3O75094 1523 aa29.35■■■□□ 2.29
CITED1-201ENST00000246139 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.35■■■□□ 2.29
CITED1-201ENST00000246139 APBA3O96018 575 aa29.32■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 TMF1P82094 1093 aa29.32■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 PDE3BQ13370 1112 aa29.32■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.31■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.31■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 NME9Q86XW9 330 aa29.31■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 A0A1W2PP64 1363 aa29.29■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.29■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.29■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.28■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 RREB1Q92766 1687 aa29.28■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CITED1-201ENST00000246139 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.26■■■□□ 2.27
CITED1-201ENST00000246139 CRB1P82279 1406 aa29.26■■■□□ 2.27
CITED1-201ENST00000246139 USP31Q70CQ4 1352 aa29.26■■■□□ 2.27
CITED1-201ENST00000246139 COL18A1P39060 1754 aa29.25■■■□□ 2.27
CITED1-201ENST00000246139 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.25■■■□□ 2.27
CITED1-201ENST00000246139 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.22■■■□□ 2.27
CITED1-201ENST00000246139 CDCA8Q53HL2 280 aa29.22■■■□□ 2.27
CITED1-201ENST00000246139 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.22■■■□□ 2.27
CITED1-201ENST00000246139 PEAK1Q9H792 1746 aa29.2■■■□□ 2.27
CITED1-201ENST00000246139 NFAT5O94916 1531 aa29.19■■■□□ 2.26
CITED1-201ENST00000246139 RGPD5Q99666 1765 aa29.18■■■□□ 2.26
CITED1-201ENST00000246139 LRRC37A3O60309 1634 aa29.17■■■□□ 2.26
CITED1-201ENST00000246139 SBF2Q86WG5 1849 aa29.17■■■□□ 2.26
CITED1-201ENST00000246139 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.16■■■□□ 2.26
CITED1-201ENST00000246139 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.16■■■□□ 2.26
CITED1-201ENST00000246139 DDB1Q16531 1140 aa29.15■■■□□ 2.26
CITED1-201ENST00000246139 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.15■■■□□ 2.26
CITED1-201ENST00000246139 USP54Q70EL1 1684 aa29.14■■■□□ 2.26
CITED1-201ENST00000246139 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.13■■■□□ 2.25
CITED1-201ENST00000246139 COG3Q96JB2 828 aa29.13■■■□□ 2.25
CITED1-201ENST00000246139 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CITED1-201ENST00000246139 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.11■■■□□ 2.25
CITED1-201ENST00000246139 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.11■■■□□ 2.25
CITED1-201ENST00000246139 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.11■■■□□ 2.25
CITED1-201ENST00000246139 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
CITED1-201ENST00000246139 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.1■■■□□ 2.25
CITED1-201ENST00000246139 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CITED1-201ENST00000246139 NBPF14Q5TI25 921 aa29.08■■■□□ 2.25
CITED1-201ENST00000246139 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CITED1-201ENST00000246139 ABCC6O95255 1503 aa29.07■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.07■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 CCDC7Q96M83 1385 aa29.05■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 ERBB3P21860 1342 aa29.05■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 EXOC5O00471 708 aa29.05■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.03■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 FYB1O15117 783 aa29.03■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 IP6K1Q92551 441 aa29.03■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.03■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 FBLN1P23142 703 aa29.02■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.02■■■□□ 2.24
CITED1-201ENST00000246139 PLSCR1O15162 318 aa29.01■■■□□ 2.23
CITED1-201ENST00000246139 AMPHP49418 695 aa29.01■■■□□ 2.23
CITED1-201ENST00000246139 PROM2Q8N271 834 aa29.01■■■□□ 2.23
CITED1-201ENST00000246139 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CITED1-201ENST00000246139 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CITED1-201ENST00000246139 LTN1O94822 1766 aa29■■■□□ 2.23
CITED1-201ENST00000246139 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.99■■■□□ 2.23
CITED1-201ENST00000246139 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.98■■■□□ 2.23
CITED1-201ENST00000246139 MYOM1P52179 1685 aa28.98■■■□□ 2.23
CITED1-201ENST00000246139 BCL9O00512 1426 aa28.96■■■□□ 2.23
CITED1-201ENST00000246139 IL2RBP14784 551 aa28.96■■■□□ 2.23
CITED1-201ENST00000246139 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CITED1-201ENST00000246139 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.95■■■□□ 2.23
CITED1-201ENST00000246139 KCNQ2O43526 872 aa28.95■■■□□ 2.22
CITED1-201ENST00000246139 HOXC9P31274 260 aa28.95■■■□□ 2.22
CITED1-201ENST00000246139 SPON1Q9HCB6 807 aa28.95■■■□□ 2.22
CITED1-201ENST00000246139 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CITED1-201ENST00000246139 CASZ1Q86V15 1759 aa28.93■■■□□ 2.22
CITED1-201ENST00000246139 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.88■■■□□ 2.21
CITED1-201ENST00000246139 TNS2Q63HR2 1409 aa28.87■■■□□ 2.21
CITED1-201ENST00000246139 TXNRD1Q16881 649 aa28.87■■■□□ 2.21
CITED1-201ENST00000246139 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CITED1-201ENST00000246139 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.85■■■□□ 2.21
CITED1-201ENST00000246139 RTL1A6NKG5 1358 aa28.85■■■□□ 2.21
CITED1-201ENST00000246139 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.84■■■□□ 2.21
CITED1-201ENST00000246139 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
CITED1-201ENST00000246139 NHSQ6T4R5 1651 aa28.83■■■□□ 2.21
CITED1-201ENST00000246139 ZBTB7AO95365 584 aa28.82■■■□□ 2.2
CITED1-201ENST00000246139 PANK3Q9H999 370 aa28.82■■■□□ 2.2
CITED1-201ENST00000246139 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.8■■■□□ 2.2
CITED1-201ENST00000246139 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.79■■■□□ 2.2
CITED1-201ENST00000246139 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CITED1-201ENST00000246139 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.79■■■□□ 2.2
CITED1-201ENST00000246139 NBPF4Q96M43 638 aa28.79■■■□□ 2.2
CITED1-201ENST00000246139 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
CITED1-201ENST00000246139 PTGER2P43116 358 aa28.78■■■□□ 2.2
CITED1-201ENST00000246139 SLC15A2Q16348 729 aa28.78■■■□□ 2.2
CITED1-201ENST00000246139 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms