RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240100.6

DUSP4-201, Transcript of dual specificity phosphatase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP4, Length 5,537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4-201ENST00000240100 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP4-201ENST00000240100 KINO60870 393 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
DUSP4-201ENST00000240100 VPS37DQ86XT2 251 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP4-201ENST00000240100 NSD2O96028 1365 aa20.59■□□□□ 0.89
DUSP4-201ENST00000240100 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
DUSP4-201ENST00000240100 FBXW7Q969H0 707 aa20.58■□□□□ 0.89
DUSP4-201ENST00000240100 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 FIBPO43427 364 aa20.58■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 CCP110O43303 1012 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 XBP1P17861 261 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 CCDC192P0DO97 292 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 ATF3P18847 181 aa20.57■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.56■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.55■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.54■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.54■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.53■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.53■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 KRT85P78386 507 aa20.53■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.52■□□□□ 0.88
DUSP4-201ENST00000240100 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.52■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 PTPRKQ15262 1439 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 TNMDQ9H2S6 317 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 NUP160Q12769 1436 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 ADGRL1O94910 1474 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 ESPNB1AK53 854 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 SMC2O95347 1197 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 STK38Q15208 465 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 JMYQ8N9B5 988 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 SRGAP3O43295 1099 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 PDILTQ8N807 584 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 RAB11FIP3O75154 756 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 KRT32Q14532 448 aa20.46■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.46■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 AK7Q96M32 723 aa20.46■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.46■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 AACSQ86V21 672 aa20.46■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.46■□□□□ 0.87
DUSP4-201ENST00000240100 IL16Q14005 1332 aa20.45■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.45■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.45■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 MX1P20591 662 aa20.44■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.44■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.44■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 SPC24Q8NBT2 197 aa20.44■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 SPG7Q9UQ90 795 aa20.44■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 RAPGEF3O95398 923 aa20.43■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.43■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 SMARCE1Q969G3 411 aa20.43■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 RUFY1Q96T51 708 aa20.43■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.43■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 CFAP45Q9UL16 551 aa20.43■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 SPATA32Q96LK8 384 aa20.43■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.42■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 TRIM27P14373 513 aa20.42■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 SKAP1Q86WV1 359 aa20.42■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.42■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.42■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 STK3Q13188 491 aa20.42■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.42■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 BTBD11A6QL63 1104 aa20.42■□□□□ 0.86
DUSP4-201ENST00000240100 DACH1Q9UI36 760 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms