RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
SYF2-201ENST00000236273 STRN4Q9NRL3 753 aa30.79■■■□□ 2.52
SYF2-201ENST00000236273 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
SYF2-201ENST00000236273 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
SYF2-201ENST00000236273 RGPD5Q99666 1765 aa30.77■■■□□ 2.52
SYF2-201ENST00000236273 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.52
SYF2-201ENST00000236273 LTN1O94822 1766 aa30.76■■■□□ 2.51
SYF2-201ENST00000236273 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa30.75■■■□□ 2.51
SYF2-201ENST00000236273 EVA1CP58658 441 aa30.74■■■□□ 2.51
SYF2-201ENST00000236273 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.73■■■□□ 2.51
SYF2-201ENST00000236273 ABCC6O95255 1503 aa30.72■■■□□ 2.51
SYF2-201ENST00000236273 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.7■■■□□ 2.51
SYF2-201ENST00000236273 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
SYF2-201ENST00000236273 SEPT12Q8IYM1 358 aa30.68■■■□□ 2.5
SYF2-201ENST00000236273 IP6K1Q92551 441 aa30.68■■■□□ 2.5
SYF2-201ENST00000236273 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.67■■■□□ 2.5
SYF2-201ENST00000236273 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
SYF2-201ENST00000236273 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
SYF2-201ENST00000236273 CRB1P82279 1406 aa30.66■■■□□ 2.5
SYF2-201ENST00000236273 BRWD3Q6RI45 1802 aa30.65■■■□□ 2.5
SYF2-201ENST00000236273 USP35Q9P2H5 1018 aa30.65■■■□□ 2.5
SYF2-201ENST00000236273 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.63■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa30.63■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 HOXC9P31274 260 aa30.63■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 BARGINQ6ZT62 677 aa30.63■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 ERBB3P21860 1342 aa30.62■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 TCP11L2Q8N4U5 519 aa30.62■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 KNSTRNQ9Y448 316 aa30.62■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa30.6■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 PEAK1Q9H792 1746 aa30.6■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 NSD2O96028 1365 aa30.6■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30.59■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 AMPHP49418 695 aa30.58■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.58■■■□□ 2.49
SYF2-201ENST00000236273 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa30.57■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 RTL1A6NKG5 1358 aa30.57■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 EP400Q96L91 3159 aa30.56■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa30.56■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 POLKQ9UBT6 870 aa30.55■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa30.54■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.53■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.53■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 KRT27Q7Z3Y8 459 aa30.52■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JS52 829 aa30.51■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 MYT1Q01538 1121 aa30.51■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.48
SYF2-201ENST00000236273 FLT4P35916 1363 aa30.51■■■□□ 2.47
SYF2-201ENST00000236273 MORC1Q86VD1 984 aa30.5■■■□□ 2.47
SYF2-201ENST00000236273 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.5■■■□□ 2.47
SYF2-201ENST00000236273 INSRP06213 1382 aa30.5■■■□□ 2.47
SYF2-201ENST00000236273 DISP2A7MBM2 1401 aa30.5■■■□□ 2.47
SYF2-201ENST00000236273 WNK3Q9BYP7 1800 aa30.48■■■□□ 2.47
SYF2-201ENST00000236273 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa30.48■■■□□ 2.47
SYF2-201ENST00000236273 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
SYF2-201ENST00000236273 RGPD2P0DJD1 1756 aa30.48■■■□□ 2.47
SYF2-201ENST00000236273 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
SYF2-201ENST00000236273 FAM182BQ5T319 152 aa30.45■■■□□ 2.46
SYF2-201ENST00000236273 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
SYF2-201ENST00000236273 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
SYF2-201ENST00000236273 NBPF6Q5VWK0 638 aa30.44■■■□□ 2.46
SYF2-201ENST00000236273 NBPF4Q96M43 638 aa30.44■■■□□ 2.46
SYF2-201ENST00000236273 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
SYF2-201ENST00000236273 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
SYF2-201ENST00000236273 LRRC37A3O60309 1634 aa30.41■■■□□ 2.46
SYF2-201ENST00000236273 IL2RBP14784 551 aa30.37■■■□□ 2.45
SYF2-201ENST00000236273 PDE3BQ13370 1112 aa30.37■■■□□ 2.45
SYF2-201ENST00000236273 DDB1Q16531 1140 aa30.37■■■□□ 2.45
SYF2-201ENST00000236273 USHBP1Q8N6Y0 703 aa30.35■■■□□ 2.45
SYF2-201ENST00000236273 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
SYF2-201ENST00000236273 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
SYF2-201ENST00000236273 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
SYF2-201ENST00000236273 NCAPD2Q15021 1401 aa30.32■■■□□ 2.44
SYF2-201ENST00000236273 EXOC5O00471 708 aa30.32■■■□□ 2.44
SYF2-201ENST00000236273 EYA1Q99502 592 aa30.32■■■□□ 2.44
SYF2-201ENST00000236273 MTHFSP49914 203 aa30.3■■■□□ 2.44
SYF2-201ENST00000236273 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
SYF2-201ENST00000236273 FAM196AQ6ZSG2 479 aa30.3■■■□□ 2.44
SYF2-201ENST00000236273 CCDC125Q86Z20 511 aa30.3■■■□□ 2.44
SYF2-201ENST00000236273 MEGF6O75095 1541 aa30.3■■■□□ 2.44
SYF2-201ENST00000236273 TNS2Q63HR2 1409 aa30.3■■■□□ 2.44
SYF2-201ENST00000236273 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa30.24■■■□□ 2.43
SYF2-201ENST00000236273 BCL9O00512 1426 aa30.24■■■□□ 2.43
SYF2-201ENST00000236273 IL13P35225 146 aa30.23■■■□□ 2.43
SYF2-201ENST00000236273 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.22■■■□□ 2.43
SYF2-201ENST00000236273 SHANK3Q9BYB0 1731 aa30.22■■■□□ 2.43
SYF2-201ENST00000236273 TRIM37O94972 964 aa30.22■■■□□ 2.43
SYF2-201ENST00000236273 SBF2Q86WG5 1849 aa30.21■■■□□ 2.43
SYF2-201ENST00000236273 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
SYF2-201ENST00000236273 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa30.2■■■□□ 2.42
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R1AP30153 589 aa30.19■■■□□ 2.42
SYF2-201ENST00000236273 RGPD1P0DJD0 1748 aa30.19■■■□□ 2.42
SYF2-201ENST00000236273 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
SYF2-201ENST00000236273 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
SYF2-201ENST00000236273 TATP17735 454 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms