RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520400.5

CTNNA1-222, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 4

Gene CTNNA1, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-222	ENST00000520400	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	SCRIB	Q14160	1630 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	TAF1	P21675	1872 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400		A0A096LPK6	155 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	PPEF2	O14830	753 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	PAGE4	O60829	102 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	MOSPD3	O75425	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	GJB3	O75712	270 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	RGS11	O94810	467 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	TF	P02787	698 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	PTPN2	P17706	415 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	GNLY	P22749	145 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ME1	P48163	572 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	GNAQ	P50148	359 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	CDH12	P55289	794 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	OLR1	P78380	273 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	PTGR1	Q14914	329 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	CES5A	Q6NT32	575 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	RNF183	Q96D59	192 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400		A6NCN8	305 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	GFPT2	O94808	682 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	PSG1	P11464	419 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	RARG	P13631	454 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	AGA	P20933	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	CHM	P24386	653 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	MLH1	P40692	756 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	NR4A2	P43354	598 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	GPR12	P47775	334 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	RUNX2	Q13950	521 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	LCTL	Q6UWM7	567 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	USP6NL	Q92738	828 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	CDT1	Q9H211	546 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	SEC14L5	O43304	696 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	SEC14L2	O76054	403 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	KLKB1	P03952	638 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ETFA	P13804	333 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	BSG	P35613	385 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTNNA1-222	ENST00000520400	PIGA	P37287	484 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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