RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CST8O60676 142 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CCNB1P14635 433 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CCZ1BP86790 482 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TFDP2Q14188 446 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 IHHQ14623 411 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 BRAT1Q6PJG6 821 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CCDC13Q8IYE1 715 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TMEM145Q8NBT3 493 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ALG3Q92685 438 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 IL21RQ9HBE5 538 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 FZD3Q9NPG1 666 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.132e-17■□□□□ 8.6
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ACTB-206ENST00000443528 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CCDC66A2RUB6 948 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 DCDC2BA2VCK2 349 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 UPK3BL1B0FP48 263 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 UPK3BL2E5RIL1 263 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 KCNK1O00180 336 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 NEMP1O14524 444 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PRKCGP05129 697 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CTSKP43235 329 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SUOXP51687 545 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PDK1Q15118 436 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PPP2R5EQ16537 467 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 HLA-BQ31612 363 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 UAP1L1Q3KQV9 507 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TMEM52BQ4KMG9 183 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 RALGPS1Q5JS13 557 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 FAM182AQ5T1J6 154 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ALG1LQ6GMV1 187 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CCDC50Q8IVM0 306 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 IL12RB2Q99665 862 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 MYOCQ99972 504 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 HERPUD2Q9BSE4 406 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 GAREM1Q9H706 876 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 AMACRQ9UHK6 382 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CACNA1EQ15878 2313 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 DNAH14Q0VDD8 3507 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 H0Y8X5 98 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 KCNK3O14649 394 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 RAD51BO15315 384 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 MMP20O60882 483 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 OPHN1O60890 802 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SOCS5O75159 536 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 FTCDO95954 541 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 JCHAINP01591 159 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 HLA-DQB2P05538 268 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TGM2P21980 687 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 XPAP23025 273 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 NR2C2P49116 596 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 RWDD2BP57060 319 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 C21orf59P57076 290 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 COPS2P61201 443 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 DSC2Q02487 901 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ITKQ08881 620 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ELP6Q0PNE2 266 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 TRAF2Q12933 501 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ZBTB17Q13105 803 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 STAT4Q14765 748 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CFAP58Q5T655 872 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 IL27RAQ6UWB1 636 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PEX26Q7Z412 305 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ZSCAN30Q86W11 494 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 CNTD1Q8N815 330 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 MFSD2AQ8NA29 543 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ARRDC2Q8TBH0 407 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 ASB12Q8WXK4 309 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SPOCK2Q92563 424 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SEMA3CQ99985 751 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 HEMGNQ9BXL5 484 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 AMFRQ9UKV5 643 aa15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
ACTB-206ENST00000443528 SHROOM3Q8TF72 1996 aa15.84■□□□□ 0.13
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