RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LINGO4Q6UY18 593 aa22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM47EQ6ZV65 393 aa22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GALNT7Q86SF2 657 aa22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRSK1Q8TDC3 778 aa22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOC2Q96KP1 924 aa22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCL26Q9Y258 94 aa22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BPTFQ12830 3046 aa22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR91A4D1P6 747 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL1BP01584 269 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYBBP04839 570 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC1A2P43004 574 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLK1P53350 603 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GALNT3Q14435 633 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF470Q6ECI4 717 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RETSATQ6NUM9 610 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM42Q8IWZ5 723 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC16Q8NEE8 873 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TDP1Q9NUW8 608 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIRPGQ9P1W8 387 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EMCNQ9ULC0 261 aa22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRLP01236 227 aa22.02■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCF3P15923 654 aa22.02■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRM3Q14832 879 aa22.02■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCEH1Q6PIU2 408 aa22.02■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.02■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BHMTQ93088 406 aa22.02■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLCD4Q9BRC7 762 aa22.02■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO5Q9UKT4 447 aa22.02■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MPP1Q00013 466 aa22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFT88Q13099 833 aa22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTBP1Q13363 440 aa22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPM6BQ13491 265 aa22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC12A1Q13621 1099 aa22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPM1JQ5JR12 505 aa22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLEC14AQ86T13 490 aa22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APCDD1Q8J025 514 aa22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LMLNQ96KR4 655 aa22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHKBQ9Y259 395 aa22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYO1CO00159 1063 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLIN3O60664 434 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BPGMP07738 259 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 F7P08709 466 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCG1P45844 678 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RHOAP61586 193 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LMAN2Q12907 356 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LCA5Q86VQ0 697 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIN3Q8TB24 985 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAI2Q9Y5P3 530 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A096LPK6 155 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF197O14709 1029 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAPLNO95428 1278 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMA3P25788 255 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD151P48509 253 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHG6Q3KR16 790 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OTOAQ7RTW8 1153 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACVR1CQ8NER5 493 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STYXQ8WUJ0 223 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADGRE3Q9BY15 652 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLK2Q9NYY3 685 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD65E5RJM6 399 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRTAMO95727 393 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSRP00390 522 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PENKP01210 267 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PROCP04070 461 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C2P06681 752 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BGNP21810 368 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARSDP51689 593 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AP1S1P61966 158 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC20A2Q08357 652 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP4Q13107 963 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF77Q15935 545 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC153Q494R4 210 aa21.99■■□□□ 1.11
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF135Q8IUD6 432 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms