RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 PLIN5Q00G26 463 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 GUCY2DQ02846 1103 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 TWF1Q12792 350 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 SSPNQ14714 243 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 HEATR4Q86WZ0 1026 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 CDH26Q8IXH8 852 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 VN1R2Q8NFZ6 395 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 HSFY1Q96LI6 401 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 DESI2Q9BSY9 194 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 MYH10P35580 1976 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 SOBPA7XYQ1 873 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 TNFRSF10BO14763 440 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 SOAT2O75908 522 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 SNX4O95219 450 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 RASGRP1O95267 797 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 GLP2RO95838 553 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 MYBL1P10243 752 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 COL6A2P12110 1019 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 UNGP13051 313 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 FOSL2P15408 326 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 ALAS2P22557 587 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 HSD3B2P26439 372 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 ABCG1P45844 678 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 MASP1P48740 699 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 GPR15P49685 360 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 IST1P53990 364 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 RALGDSQ12967 914 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PTK2BQ14289 1009 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 VEPH1Q14D04 833 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PMF1Q6P1K2 205 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PIGZQ86VD9 579 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 SLC30A5Q8TAD4 765 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 NCLNQ969V3 563 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 NOX5Q96PH1 765 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 VPS35Q96QK1 796 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PCDHB18PQ96TA0 734 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 CHP1Q99653 195 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 SP140LQ9H930 580 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 MALT1Q9UDY8 824 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.271e-14■■□□□ 14.3
CS-201ENST00000351328 LINC01565O15544 149 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PRMT3O60678 531 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 RPS17P08708 135 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 CSH1P0DML2 217 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 CSH2P0DML3 217 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PKLRP30613 574 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 ATP6V0D1P61421 351 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 NOMO3P69849 1222 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 ZNF124Q15973 351 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 RAB41Q5JT25 222 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 ANKRD54Q6NXT1 300 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 KDELC1Q6UW63 502 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 STX12Q86Y82 276 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 ZNF565Q8N9K5 539 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 OLIG1Q8TAK6 271 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PSMG2Q969U7 264 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 HDAC11Q96DB2 347 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PSD2Q9BQI7 771 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 ADAM22Q9P0K1 906 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-201ENST00000351328 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms