RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CFHR3Q02985 330 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAP1Q03518 808 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZBTB16Q05516 673 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TP53BP2Q13625 1128 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEMA3AQ14563 771 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 E2F5Q15329 346 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGSF11Q5DX21 431 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 METTL23Q86XA0 190 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NAT8LQ8N9F0 302 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SYT8Q8NBV8 401 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DUSP19Q8WTR2 217 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMCO6Q96DC7 493 aa5.14□□□□□ -1.59
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 DGAT2Q96PD7 388 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC106Q9BWC9 280 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM129AQ9BZQ8 928 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLC2Q9H0B6 622 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.14□□□□□ -1.59
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 ASAH2Q9NR71 780 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABI3Q9P2A4 366 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ICKQ9UPZ9 632 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDR27A2RRH5 827 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLIC1O00299 241 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PSMA7O14818 248 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCAMP1O15126 338 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NUAK1O60285 661 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LPXNO60711 386 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NDUFS3O75489 264 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TJP3O95049 919 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NKX2-2O95096 273 aa5.13□□□□□ -1.59
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 C22orf31O95567 290 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPSP0C0P6 89 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DMWDQ09019 674 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PKN1Q16512 942 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPE65Q16518 533 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TXNRD1Q16881 649 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LETM2Q2VYF4 491 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAT1Q6PIZ9 186 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PET117Q6UWS5 81 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DHRS13Q6UX07 377 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAPH1Q70E73 1250 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LIMS2Q7Z4I7 341 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPHX4Q8IUS5 362 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LNX2Q8N448 690 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AMER2Q8N7J2 671 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EXD3Q8N9H8 876 aa5.13□□□□□ -1.59
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TFAP2BQ92481 460 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IP6K1Q92551 441 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KAZALD1Q96I82 304 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BBS4Q96RK4 519 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MMS19Q96T76 1030 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GAD1Q99259 594 aa5.13□□□□□ -1.59
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 HRH4Q9H3N8 390 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SETD4Q9NVD3 440 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COQ3Q9NZJ6 369 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANAPC2Q9UJX6 822 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DTX4Q9Y2E6 619 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRBC2A0A5B9 178 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A6NL46 340 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC25A12O75746 678 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FTCDO95954 541 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TFP02787 698 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITGAMP11215 1152 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FDPSP14324 419 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM11P17152 192 aa5.12□□□□□ -1.59
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