RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438265.5

RPE-211, Transcript of ribulose-5-phosphate-3-epimerase, humanhuman

TSL 3

Gene RPE, Length 668 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE-211ENST00000438265 CER1O95813 267 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 RHOCP08134 193 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 CD27P26842 260 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 OR1E1P30953 314 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 NNMTP40261 264 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 ARL4AP40617 200 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 GRIA4P48058 902 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 PSMD8P48556 350 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 TPI1P60174 286 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 ECT2LQ008S8 904 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 SLC20A2Q08357 652 aa8.44□□□□□ -1.06
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RPE-211ENST00000438265 CST6Q15828 149 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 POM121L1PQ3SYA9 428 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 RAB6CQ53S08 254 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 ALFQ53S48 1182 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 LRRC38Q5VT99 294 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.44□□□□□ -1.06
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RPE-211ENST00000438265 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 FAM71BQ8TC56 605 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 FRS2Q8WU20 508 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 PACSIN1Q9BY11 444 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 TRIM7Q9C029 511 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 SUN2Q9UH99 717 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 SLC25A13Q9UJS0 675 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 SCML1Q9UN30 329 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.44□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 A0A1B0GTQ1 180 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 A0A1W2PPC4 97 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 H3BRJ5 948 aa8.43□□□□□ -1.06
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RPE-211ENST00000438265 PJA2O43164 708 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 ATP9BO43861 1147 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 RAMP2O60895 175 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 SRGAP2O75044 1071 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 TRIM16O95361 564 aa8.43□□□□□ -1.06
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RPE-211ENST00000438265 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 RFX8Q6ZV50 586 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 PDZD3Q86UT5 571 aa8.43□□□□□ -1.06
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RPE-211ENST00000438265 MUC3BQ9H195 1237 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 MPP6Q9NZW5 540 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 VPS28Q9UK41 221 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 ACTL7AQ9Y615 435 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 BSNQ9UPA5 3926 aa8.43□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.42□□□□□ -1.06
RPE-211ENST00000438265 FAM72CH0Y354 149 aa8.42□□□□□ -1.06
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