RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 EMC10Q5UCC4 262 aa22.39■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.39■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.39■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 MGARPQ8TDB4 240 aa22.39■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.39■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.39■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 FETUBQ9UGM5 382 aa22.39■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 SEPT3Q9UH03 358 aa22.39■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.39■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.39■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 E2F8A0AVK6 867 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 SPAG7O75391 227 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 POLBP06746 335 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 BRAFP15056 766 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 CHN1P15882 459 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 RAB30Q15771 203 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 MPPE1Q53F39 396 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 RANBP10Q6VN20 620 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 TMEM25Q86YD3 366 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 LEMD2Q8NC56 503 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ALG14Q96F25 216 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 IL22Q9GZX6 179 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 TRABDQ9H4I3 376 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 VPS51Q9UID3 782 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ZMPSTE24O75844 475 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 CD70P32970 193 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 LMAN2Q12907 356 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 SEPT6Q14141 434 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 RASSF3Q86WH2 238 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 LRRC6Q86X45 466 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 MZB1Q8WU39 189 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ATP2A3Q93084 1043 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 MGME1Q9BQP7 344 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 PPCSQ9HAB8 311 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 SOX13Q9UN79 622 aa22.38■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 TMEM120BA0PK00 339 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ALDH1A2O94788 518 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 BMPR2Q13873 1038 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 MPP2Q14168 576 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ZNF77Q15935 545 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 SPANXN3Q5MJ09 141 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 FYB2Q5VWT5 728 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 SLC26A11Q86WA9 606 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 CCNJLQ8IV13 435 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 TADA1Q96BN2 335 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 NAT9Q9BTE0 207 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 NOD2Q9HC29 1040 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 DPP7Q9UHL4 492 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.37■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 GOLGA8RI6L899 631 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 TMCC1O94876 653 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 MT-CO1P00395 513 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 SCNN1BP51168 640 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ZNF783Q6ZMS7 281 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 BBS5Q8N3I7 341 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 PSAT1Q9Y617 370 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 K7ERQ8 282 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 GALNT3Q14435 633 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 LRRC14Q15048 493 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 RASA2Q15283 850 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 TMEM135Q86UB9 458 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 CERS2Q96G23 380 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 PSKH2Q96QS6 385 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa22.36■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 REV3LO60673 3130 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ZNF197O14709 1029 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 LINC01565O15544 149 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 USP1O94782 785 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 PRKCGP05129 697 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 USP4Q13107 963 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 VPS45Q9NRW7 570 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 MYO9BQ13459 2157 aa22.35■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 CYBBP04839 570 aa22.34■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 KCNC3Q14003 757 aa22.34■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 SLC1A5Q15758 541 aa22.34■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 PCID2Q5JVF3 399 aa22.34■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.34■■□□□ 1.17
VSX1-205ENST00000429762 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms