RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 ACADMP11310 421 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 HMGA2P52926 109 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 DRG2P55039 364 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ARF1P84077 181 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF91Q05481 1191 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 TAF11Q15544 211 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 SMTNL2Q2TAL5 461 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 CNGA4Q8IV77 575 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 CADM4Q8NFZ8 388 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 PRSS22Q9GZN4 317 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 MUC13Q9H3R2 512 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 C17orf102A2RUQ5 167 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 CGB1A6NKQ9 187 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 IFNL4K9M1U5 179 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 EBAG9O00559 213 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ADAM10O14672 748 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 TLR2O60603 784 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 GFPT2O94808 682 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 SLC2A4P14672 509 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 EDN2P20800 178 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 MAPK4P31152 587 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-205ENST00000391970 RYKP34925 604 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-205ENST00000391970 GPR12P47775 334 aa3.29□□□□□ -1.88
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