RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 MRGPRX2Q96LB1 330 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 MCMBPQ9BTE3 642 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 NMUR2Q9GZQ4 415 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 ARMCX1Q9P291 453 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 TRANK1O15050 2925 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 FAM92AA1XBS5 289 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 OR6C75A6NL08 312 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 WASH4PA8MWX3 477 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 PSMD3O43242 534 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 DNAJC6O75061 913 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 ANXA9O76027 345 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 ADRA1AP35348 466 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 AQP5P55064 265 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 PCSK7Q16549 785 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 SPDYAQ5MJ70 313 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 CRLF3Q8IUI8 442 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 ARHGAP18Q8N392 663 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 PBX4Q9BYU1 374 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa18.38■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 A0A096LPK6 155 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 FCHO1O14526 889 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 ARRB2P32121 409 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 OR1D2P34982 312 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 BMPR1AP36894 532 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 MAXP61244 160 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 PCID2Q5JVF3 399 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 C10orf120Q5SQS8 335 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 PKN3Q6P5Z2 889 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 FBXO22Q8NEZ5 403 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 GIPC2Q8TF65 315 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 INPP5DQ92835 1189 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 MYEOVQ96EZ4 313 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 VPS39Q96JC1 886 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 ZYG11BQ9C0D3 744 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 THAP1Q9NVV9 213 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 KCNK4Q9NYG8 393 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 COPG2Q9UBF2 871 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 DOCK4Q8N1I0 1966 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 XIRP2A4UGR9 3374 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 NEBLO76041 1014 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 SLC2A3P11169 496 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 GEMP55040 296 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 DUSP4Q13115 394 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 RIPK1Q13546 671 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 GRM3Q14832 879 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 INSCQ1MX18 579 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 FBXL22Q6P050 247 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 ANKS3Q6ZW76 656 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 CLSTN3Q9BQT9 956 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 EBF4Q9BQW3 602 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 FSD1LQ9BXM9 530 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 CCSER2Q9H7U1 834 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 SAR1AQ9NR31 198 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 MARCH2Q9P0N8 246 aa18.37■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 SLC12A8A0AV02 714 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 TBC1D4O60343 1298 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 SAT1P21673 171 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 GABRB3P28472 473 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 PPM1AP35813 382 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 SLC1A6P48664 564 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 ERVFC1P60507 584 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 SLC10A7Q0GE19 358 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 GPR17Q13304 367 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 GREB1Q4ZG55 1949 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 PDPK2PQ6A1A2 396 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 DENND6AQ8IWF6 608 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 NT5MQ9NPB1 228 aa18.36■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 AP3B1O00203 1094 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 CHUKO15111 745 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 VAPBO95292 243 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 URODP06132 367 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 C2P06681 752 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 RHOQP17081 205 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 ARNTP27540 789 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 MPP1Q00013 466 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 DSG1Q02413 1049 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 LONP2Q86WA8 852 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 ZNF354CQ86Y25 554 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 SLC25A41Q8N5S1 370 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 PSMG2Q969U7 264 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 MIPEPQ99797 713 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 TMEM248Q9NWD8 314 aa18.35■□□□□ 0.53
USP18-201ENST00000215794 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms