RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-211ENST00000592385 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 RGSL1A5PLK6 1076 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 MAFKO60675 156 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PIGNO95427 931 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 RGS2P41220 211 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 RAB10P61026 200 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ACAD11Q709F0 780 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TMC7Q7Z402 723 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 KCTD4Q8WVF5 259 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 SCYL1Q96KG9 808 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CCDC28BQ9BUN5 200 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 SIK2Q9H0K1 926 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ABCC13Q9NSE7 274 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TCAF1Q9Y4C2 921 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ASB3Q9Y575 518 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 GPR182O15218 404 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF623O75123 536 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CHRNA1P02708 482 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TFEBP19484 476 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PIK3R1P27986 724 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ADRA1AP35348 466 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 GRIK3Q13003 919 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 HPS6Q86YV9 775 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 IPMKQ8NFU5 416 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 IFT43Q96FT9 208 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PDP2Q9P2J9 529 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 MYLKQ15746 1914 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 M0QZQ0 153 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PAGE1O75459 146 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 AKR1A1P14550 325 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 STMN1P16949 149 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PAMP19021 973 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 SAT1P21673 171 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CCR1P32246 355 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 NAGLUP54802 743 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PPP2R5DQ14738 602 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 POU6F1Q14863 301 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 LRRC49Q8IUZ0 686 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 AGR3Q8TD06 166 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 FICDQ9BVA6 458 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 SMOC2Q9H3U7 446 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF385DQ9H6B1 395 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TMLHEQ9NVH6 421 aa15.48■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 GRID2O43424 1007 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ZMPSTE24O75844 475 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 B3GAT3O94766 335 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 VAPBO95292 243 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ARNTP27540 789 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 RAB27AP51159 221 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PEX6Q13608 980 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 C16orf89Q6UX73 402 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 KBTBD6Q86V97 674 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PDSS2Q86YH6 399 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 GPR78Q96P69 363 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 SERPINI1Q99574 410 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 SLC39A8Q9C0K1 460 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 YIPF3Q9GZM5 350 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TREX1Q9NSU2 369 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CDYLQ9Y232 598 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PCNTO95613 3336 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CCDC78A2IDD5 438 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CTSHP09668 335 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 SERPINB5P36952 375 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 GLRBP48167 497 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 MPP1Q00013 466 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 HERC3Q15034 1050 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 AFMIDQ63HM1 303 aa15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 182.5 ms