RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNGP13051 313 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JUPP14923 745 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHOQP17081 205 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGB7P26010 798 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACVRL1P37023 503 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPKAPK2P49137 400 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTP4A2Q12974 167 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEL1L3Q68CR1 1132 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEK11Q8NG66 645 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHB18PQ96TA0 734 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDFIP2Q9NV92 336 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL11Q9NVR0 708 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAM22Q9P0K1 906 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAI1Q9UI46 699 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM72CH0Y354 149 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADRB3P13945 408 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CKMT2P17540 419 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 L1CAMP32004 1257 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM259Q4ZIN3 620 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM72AQ5TYM5 149 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM72DQ6L9T8 149 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXL19Q6PCT2 694 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SASS6Q6UVJ0 657 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLRP14Q86W24 1093 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM72BQ86X60 149 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR13H1Q8NG92 308 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM172AQ8WUF8 416 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CALN1Q9BXU9 219 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANO10Q9NW15 660 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM248Q9NWD8 314 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACTL7AQ9Y615 435 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CACNA1GO43497 2377 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDAC4P56524 1084 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN6P56747 220 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYL5Q02045 173 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ILKQ13418 452 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC185Q8N715 623 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D31Q96DN5 1066 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SELENOOQ9BVL4 669 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TM6SF2Q9BZW4 377 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEH1Q9H213 219 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HPCAL4Q9UM19 191 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTS20P59510 1910 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LGALS16A8MUM7 142 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRIG2O94898 1065 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD160O95971 181 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CALB1P05937 261 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSCP56915 257 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN2P57739 230 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS21P63220 83 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCNT7Q6ZNI0 430 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLPP6Q8IY26 295 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A45Q8N413 288 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM174AQ8TBP5 190 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FEM1CQ96JP0 617 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GBP4Q96PP9 640 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC17A9Q9BYT1 436 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEB5Q9BZ81 275 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEU3Q9UQ49 428 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FADS3Q9Y5Q0 445 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIGLEC6O43699 453 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAMP2O60895 175 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPD1P21695 349 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DGKAP23743 735 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBXN1Q04323 297 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PROX2Q3B8N5 592 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HS1BP3Q53T59 392 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HES3Q5TGS1 186 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C3orf20Q8ND61 904 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NTAN1Q96AB6 310 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KNTC1P50748 2209 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A6NNZ2 444 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM38O00635 465 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP1G1O43747 822 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STX1AQ16623 288 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL28A1Q2UY09 1125 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR59Q6PJI9 974 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR6K2Q8NGY2 324 aa26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms