RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 GSRP00390 522 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 PRNPP04156 253 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 KRT7P08729 469 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 GKP32189 559 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 CNTN1Q12860 1018 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 KCTD6Q8NC69 237 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 OR2AP1Q8NGE2 309 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 ARRDC3Q96B67 414 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-206ENST00000443528 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-206ENST00000443528 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 HYOU1Q9Y4L1 999 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-206ENST00000443528 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
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ACTB-206ENST00000443528 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 PQLC3Q8N755 202 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 CEP76Q8TAP6 659 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 SNX19Q92543 992 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-206ENST00000443528 HDAC8Q9BY41 377 aa15.96■□□□□ 0.15
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