RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 BROXQ5VW32 411 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 RASSF5Q8WWW0 418 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 TRIB2Q92519 343 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 BIRC7Q96CA5 298 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 C12orf10Q9HB07 376 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.69□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 KCNU1A8MYU2 1149 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 F8VP50 259 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 GPC4O75487 556 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 NAGAP17050 411 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 HDCP19113 662 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 RRM2P31350 389 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 CYP2C18P33260 490 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 CRHR1P34998 444 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 VBP1P61758 197 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 RHDQ02161 417 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 PRPSAP1Q14558 356 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 SFRP1Q8N474 314 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 NDNFQ8TB73 568 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 SLCO4A1Q96BD0 722 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 IPPQ9Y573 584 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 KRT87PA6NCN2 255 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 CBLP22681 906 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 IL12AP29459 219 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 CCR10P46092 362 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 SERPINB10P48595 397 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 DGCR6Q14129 220 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 POU6F1Q14863 301 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC142Q17RM4 750 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 RAP1GAP2Q684P5 730 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 DDIASQ8IXT1 998 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 SPARTQ8N0X7 666 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 LSMEM2Q8N112 164 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 SPATA18Q8TC71 538 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 POMGNT1Q8WZA1 660 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 SEMA4DQ92854 862 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 CPNE5Q9HCH3 593 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 PCSK1NQ9UHG2 260 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 CDY2AQ9Y6F7 541 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 CDY1Q9Y6F8 540 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 ALS2Q96Q42 1657 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 HEATR9A2RTY3 570 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 C9IYK1 514 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 H0YJX3 145 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 TK2O00142 265 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 SNAP29O95721 258 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 SERPINB2P05120 415 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 IL7RP16871 459 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 MPSTP25325 297 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 GABRB2P47870 512 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 POLD2P49005 469 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 IL1RL1Q01638 556 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 BNIP2Q12982 314 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 SNTA1Q13424 505 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 DGUOKQ16854 277 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 BSPRYQ5W0U4 402 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 IDO2Q6ZQW0 420 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 UNC5BQ8IZJ1 945 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 SEPT8Q92599 483 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 SNAPC3Q92966 411 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 MCRS1Q96EZ8 462 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 NGLY1Q96IV0 654 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 UBE4BO95155 1302 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 ROBO3Q96MS0 1386 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 K7ENM7 598 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 TPP1O14773 563 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 B4GALT4O60513 344 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD1-203ENST00000395211 ITGAVP06756 1048 aa9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.2 ms