RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520400.5

CTNNA1-222, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 4

Gene CTNNA1, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-222	ENST00000520400	CHRNB1	P11230	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PMPCA	Q10713	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	HSPH1	Q92598	858 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PERP	Q96FX8	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CD180	Q99467	661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	NACAD	O15069	1562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CBY3	A6NI87	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SERPINC1	P01008	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CHRNA5	P30532	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CIITA	P33076	1130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	STAT1	P42224	750 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	UFM1	P61960	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	EFNB1	P98172	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	MTX1	Q13505	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CAMK1	Q14012	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	NELL1	Q92832	810 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400		A0A1W2PPH5	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	STRN	O43815	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	HBP1	O60381	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TACC1	O75410	805 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CD63	P08962	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	KEL	P23276	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	MAPK4	P31152	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TNFSF8	P32971	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	KRT9	P35527	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	C21orf58	P58505	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ID2	Q02363	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	COG5	Q9UP83	839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-222	ENST00000520400	EVPL	Q92817	2033 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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