RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	APOL5	Q9BWW9	433 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	POMK	Q9H5K3	350 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	GLOD4	Q9HC38	313 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	VPS45	Q9NRW7	570 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM50B	Q9Y247	325 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	NCOR1	O75376	2440 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ALOX15B	O15296	676 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	TIMM44	O43615	452 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ANXA9	O76027	345 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	CISD3	P0C7P0	127 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	TYR	P14679	529 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	MMP13	P45452	471 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	CSNK1D	P48730	415 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	NRL	P54845	237 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	LMAN2	Q12907	356 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	NR1H3	Q13133	447 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	PRPSAP1	Q14558	356 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	IL31	Q6EBC2	164 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	VIT	Q6UXI7	678 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	PLPP6	Q8IY26	295 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	BBS5	Q8N3I7	341 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	OR7D4	Q8NG98	312 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	BBS2	Q9BXC9	721 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	MUC3B	Q9H195	1237 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	SP110	Q9HB58	689 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	SEPT3	Q9UH03	358 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	CDH22	Q9UJ99	828 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	AP2A1	O95782	977 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	EPO	P01588	193 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP17A1	P05093	508 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM153B	P0C7A2	387 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	CR2	P20023	1033 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	HLA-F	P30511	346 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	CSK	P41240	450 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	MAGEA3	P43357	314 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	VPS41	P49754	854 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ARF5	P84085	180 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM153C	Q494X1	144 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	KDM1B	Q8NB78	822 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC39	Q96DD0	335 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	AGAP3	Q96P47	875 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	MGME1	Q9BQP7	344 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	SPON2	Q9BUD6	331 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ECT2	Q9H8V3	914 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	VCAN	P13611	3396 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ARNTL	O00327	626 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	MBTPS2	O43462	519 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ADH5	P11766	374 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	TSHR	P16473	764 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	GEM	P55040	296 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	ARL4C	P56559	192 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	MPP3	Q13368	585 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TRAF4-208	ENST00000469529	HTR4	Q13639	388 aa		12.96	□□□□□ -0.33

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