RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556765.1

TRAPPC6B-206, Transcript of trafficking protein particle complex 6B, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC6B, Length 664 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6B-206ENST00000556765 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SERPINB11Q96P15 392 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SNX24Q9Y343 169 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MTMR11A4FU01 709 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 EGFP01133 1207 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SLC2A3P11169 496 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ENGP17813 658 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CYP2F1P24903 491 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ADCY8P40145 1251 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CXCR3P49682 368 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DGKEP52429 567 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CACNA2D1P54289 1103 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SYT13Q7L8C5 426 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DDIT4Q9NX09 232 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 OBP2AQ9NY56 170 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SGK1O00141 431 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TK2O00142 265 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 IGLV3-25P01717 112 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FYNP06241 537 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CD48P09326 243 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RBP3P10745 1247 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RARGP13631 454 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 BCKDHBP21953 392 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ADRA1BP35368 520 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PLTPP55058 493 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ADCY2Q08462 1091 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DMC1Q14565 340 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MORF4L2Q15014 288 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 HOOK3Q86VS8 718 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FAM131BQ86XD5 332 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TMC8Q8IU68 726 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ZNF276Q8N554 614 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PLD5Q8N7P1 536 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RNF139Q8WU17 664 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SLC39A7Q92504 469 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RTP4Q96DX8 246 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CRELD1Q96HD1 420 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 EPAS1Q99814 870 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 WDCPQ9H6R7 721 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DONSONQ9NYP3 566 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 IRAK2O43187 625 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 IL4RP24394 825 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 IVDP26440 423 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 YWHAQP27348 245 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SERPINB6P35237 376 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DYNLT1P63172 113 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NME3Q13232 169 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 P3H1Q32P28 736 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ZNF605Q86T29 641 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RELL1Q8IUW5 271 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CCDC185Q8N715 623 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CHFRQ96EP1 664 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 HAPLN3Q96S86 360 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6B-206ENST00000556765 LRRC3Q9BY71 257 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms