RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 PTPRCP08575 1304 aa5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 AGAP5A6NIR3 686 aa5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 SMIM22K7EJ46 135 aa5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 TULP2O00295 520 aa5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 NPHP1O15259 732 aa5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 CKMT1AP12532 417 aa5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ZNF84P51523 738 aa5.51□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.51□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 RRN3Q9NYV6 651 aa5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 BAG5Q9UL15 447 aa5.51□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa5.51□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 ADCY5O95622 1261 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 MAPK9P45984 424 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 FAM110CQ1W6H9 321 aa5.5□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 CASC1Q6TDU7 716 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 ZNF398Q8TD17 642 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 ASB2Q96Q27 587 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 PIGSQ96S52 555 aa5.5□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 TMEM232C9JQI7 657 aa5.49□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 EVI5LQ96CN4 794 aa5.49□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.49□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 RAD50Q92878 1312 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 LRRC37A3O60309 1634 aa5.48□□□□□ -1.53
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