RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 KCND2Q9NZV8 630 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 FBXO40Q9UH90 709 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 A0A0A0MQY5 61 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 ADAP00813 363 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 CD63P08962 238 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 COX7A2P14406 83 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 CHMP24386 653 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 HARS2P49590 506 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 UFM1P61960 85 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 KRT32Q14532 448 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 C4orf50Q6ZRC1 276 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 TMTC3Q6ZXV5 915 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 CYB5R4Q7L1T6 521 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 METTL6Q8TCB7 284 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 FAR1Q8WVX9 515 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 DPF1Q92782 380 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 KIF1BPQ96EK5 621 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 CLMNQ96JQ2 1002 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SH2D3AQ9BRG2 576 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 SCNM1Q9BWG6 230 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 ZNF304Q9HCX3 659 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D22BQ9NU19 505 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TERF2IPQ9NYB0 399 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 GRHL1Q9NZI5 618 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 MPP6Q9NZW5 540 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 KLHL13Q9P2N7 655 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 NLKQ9UBE8 527 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-205ENST00000391970 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 CEP78Q5JTW2 689 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D9BQ66K14 1250 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 HAUS3Q68CZ6 603 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 ISM2Q6H9L7 571 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM81Q6P7N7 255 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 FAM57BQ71RH2 274 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-205ENST00000391970 WDR5BQ86VZ2 330 aa3.35□□□□□ -1.87
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