RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 SYTL1Q8IYJ3 562 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 VCLP18206 1134 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SERPINA4P29622 427 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 ADRA1BP35368 520 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC57Q8N9N7 239 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 FNDC5Q8NAU1 212 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 CASP10Q92851 521 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 HPS4Q9NQG7 708 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SELENONQ9NZV5 590 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 PADI3Q9ULW8 664 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SNED1Q8TER0 1413 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 FKBP6O75344 327 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 PCNAP12004 261 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TSHRP16473 764 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 USP41Q3LFD5 358 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC49Q8IUZ0 686 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 HOMEZQ8IX15 550 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKHA8Q96JA3 519 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SMPD1P17405 629 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 MON1AQ86VX9 555 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 CACUL1Q86Y37 369 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 MPP6Q9NZW5 540 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC167Q9P0B6 97 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 MEI4A8MW99 385 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 WASHC5Q12768 1159 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 HSPA13P48723 471 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC8BQ6P9F7 803 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 OR56A4Q8NGH8 313 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 DPY30Q9C005 99 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 RBPJLQ9UBG7 517 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 PIRTP0C851 137 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC166P0CW27 439 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 NOMO1Q15155 1222 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SNX32Q86XE0 403 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 ALG9Q9H6U8 611 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM114B3SHH9 223 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 OR56A5P0C7T3 313 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 MCOLN3Q8TDD5 553 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 FNIP1Q8TF40 1166 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 EXOC2Q96KP1 924 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SIKE1Q9BRV8 207 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TCHHQ07283 1943 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP2A7P20853 494 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 IL2P60568 153 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMD5Q16401 504 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 PMF1Q6P1K2 205 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 PANX3Q96QZ0 392 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SH3GL1Q99961 368 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 ASGR1P07306 291 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 HLA-DPA1P20036 260 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 XRCC4Q13426 336 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TP53BP2Q13625 1128 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TFAP2BQ92481 460 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 MED8Q96G25 268 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SCN3BQ9NY72 215 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SLIT2O94813 1529 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP6V1G2O95670 118 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 MILR1Q7Z6M3 343 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF786Q8N393 782 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SUFUQ9UMX1 484 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 OR1D2P34982 312 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 GBE1Q04446 702 aa20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms