RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 EME1Q96AY2 570 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 RMDN3Q96TC7 470 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 TUBA1CQ9BQE3 449 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 MID2Q9UJV3 735 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 A0A0A0MRY4 1105 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 TRIM43BA6NCK2 446 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 OGTO15294 1046 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 HALP42357 657 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 ACTR2P61160 394 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 CYTH1Q15438 398 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 LIPMQ5VYY2 423 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 NANOGP8Q6NSW7 305 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 ABHD8Q96I13 439 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 SPATA13Q96N96 652 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 WRNIP1Q96S55 665 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 YIPF2Q9BWQ6 316 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 PTPRHQ9HD43 1115 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 HESX1Q9UBX0 185 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa10.08□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 SNAP91O60641 907 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 TRPA1O75762 1119 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 CPNE6O95741 557 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 ZNF24P17028 368 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 CYP2F1P24903 491 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 PRKAA1Q13131 559 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 ITGA7Q13683 1181 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 KIZQ2M2Z5 673 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 MTX3Q5HYI7 312 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 FAM182AQ5T1J6 154 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 FAM45BPQ6NSW5 357 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 OLFML1Q6UWY5 402 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 CENPSQ8N2Z9 138 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 GOLM1Q8NBJ4 401 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 FAM45AQ8TCE6 357 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 TMEM143Q96AN5 459 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 CERS2Q96G23 380 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 FEM1CQ96JP0 617 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 MAF1Q9H063 256 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 C8orf4Q9NR00 106 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 MRGBPQ9NV56 204 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 TMEM181Q9P2C4 612 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 SIX4Q9UIU6 781 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 LTFP02788 710 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 OATP04181 439 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 SLC5A3P53794 718 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 INCA1Q0VD86 236 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 SLC36A3Q495N2 470 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 SEZ6Q53EL9 994 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 ERMP1Q7Z2K6 904 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 LPAR1Q92633 364 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 TMEM176AQ96HP8 235 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 SYBUQ9NX95 663 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 GIN1Q9NXP7 522 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 HMGXB4Q9UGU5 601 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 CDYLQ9Y232 598 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 DYTNA2CJ06 578 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 AMHP03971 560 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 CHRNGP07510 517 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 VDRP11473 427 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 FUT4P22083 530 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 MGAT1P26572 445 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 TYK2P29597 1187 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 RAP1GAPP47736 663 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 NRF1Q16656 503 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 MTERF2Q49AM1 385 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 PKDCCQ504Y2 493 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 ADAMTS10Q9H324 1103 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 HEY1Q9Y5J3 304 aa10.07□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa10.06□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 GOLGA8OA6NCC3 632 aa10.06□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 GOLGA8NF8WBI6 632 aa10.06□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 SOCS2O14508 198 aa10.06□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HCG18-242ENST00000602319 PDGFRAP16234 1089 aa10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms